RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243108.4

HOXC6-201, Transcript of homeobox C6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC6, Length 1,733 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6-201ENST00000243108 NRN1LQ496H8 165 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF813Q6ZN06 617 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 FAM57BQ71RH2 274 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 WDR31Q8NA23 367 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 C15orf40Q8WUR7 153 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 FOXB1Q99853 325 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 MMP28Q9H239 520 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 NGBQ9NPG2 151 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 A0A0U1RQV5 110 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 GABARAPH6UMI1 98 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 CD3GP09693 182 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 HTR2CP28335 458 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 GALK2Q01415 458 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 SPOCK1Q08629 439 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 PLA2G7Q13093 441 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 RAB35Q15286 201 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 CEACAM16Q2WEN9 425 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM69Q5SWH9 247 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 AGAP6Q5VW22 663 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 ANKRD16Q6P6B7 361 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 Q6ZSR3 168 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 Q71RC1 249 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 DOK3Q7L591 496 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 OR1M1Q8NGA1 313 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM171Q8WVE6 324 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 MUCL1Q96DR8 90 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 GPR84Q9NQS5 396 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 PARPBPQ9NWS1 579 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC6-201ENST00000243108 NAV3Q8IVL0 2385 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CIB4A0PJX0 185 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OVOL3O00110 214 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 XRCC3O43542 346 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 BDKRB2P30411 391 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SLC6A1P30531 599 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SCRN3Q0VDG4 424 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ECH1Q13011 328 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 GLYATL3Q5SZD4 288 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 PLET1Q6UQ28 207 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 DNM1P46Q6ZS02 220 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SLC22A24Q8N4F4 322 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OR5D14Q8NGL3 314 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 FBXW5Q969U6 566 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 RNF121Q9H920 327 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM138Q9NPI0 162 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CACNG2Q9Y698 323 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 FN1P02751 2386 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OR6C65A6NJZ3 312 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 M0R135 149 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ABCD4O14678 606 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 LDLRAD4O15165 306 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SGCEO43556 437 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SYNGR3O43761 229 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CD8AP01732 235 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 EFNB2P52799 333 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CAPZA1P52907 286 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 TAS2R20P59543 309 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SPTSSAQ969W0 71 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ITPKCQ96DU7 683 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF799Q96GE5 643 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 POM121Q96HA1 1249 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 PGAM5Q96HS1 289 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 AUNIPQ9H7T9 357 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 MEIOCA2RUB1 952 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OR6C6A6NF89 314 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 F5H5K5 113 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 H7C1Q1 480 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 B4GALT1P15291 398 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF20P17024 532 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 RAB3AP20336 220 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 BTCP35070 178 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 GNALP38405 381 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 ZNF83P51522 516 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 CD300CQ08708 224 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 DYRK1AQ13627 763 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 PLA1AQ53H76 456 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 BIVMQ86UB2 503 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 NAA40Q86UY6 237 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 TOMM5Q8N4H5 51 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 OR14K1Q8NGZ2 314 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 SORCS2Q96PQ0 1159 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 UQCC2Q9BRT2 126 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC6-201ENST00000243108 MARVELD1Q9BSK0 173 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.1 ms