RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa18.65■□□□□ 0.58
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GVI7 797 aa18.64■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa18.64■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 A6NLC8 198 aa18.64■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 TMEM210A6NLX4 147 aa18.64■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 CRLF1O75462 422 aa18.64■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 MSMBP08118 114 aa18.64■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 PIPP12273 146 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 IRF2P14316 349 aa18.64■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 GPM6AP51674 278 aa18.64■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 CLVS2Q5SYC1 327 aa18.64■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 OR2G6Q5TZ20 316 aa18.64■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP18.64■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 ZNF485Q8NCK3 441 aa18.64■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 OR10AC1Q8NH08 325 aa18.64■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP18.64■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 TMEM80Q96HE8 168 aa18.64■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 GPR173Q9NS66 373 aa18.64■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 FKBP14Q9NWM8 211 aa18.64■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 WNK2Q9Y3S1 2297 aa18.63■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 ZNF732B4DXR9 585 aa18.63■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 CD80P33681 288 aa18.63■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 ST3GAL4Q11206 333 aa18.63■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 TMEM244Q5VVB8 128 aa18.63■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 XAF1Q6GPH4 301 aa18.63■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 LYPD2Q6UXB3 125 aa18.63■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 KLHL36Q8N4N3 616 aa18.63■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 CCDC54Q8NEL0 328 aa18.63■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 DEFB108BQ8NET1 73 aa18.63■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa18.63■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 KCNS2Q9ULS6 477 aa18.63■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 CUBNO60494 3623 aa18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 IRGMA1A4Y4 181 aa18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 LGALS8O00214 317 aa18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 TGM4P49221 684 aa18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 GNG3P63215 75 aa18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 UBE2V2Q15819 145 aa18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 C6orf141Q5SZD1 244 aa18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 TEX36Q5VZQ5 186 aa18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 PLCXD3Q63HM9 321 aa18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 OR51A4Q8NGJ6 313 aa18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 RPS4Y2Q8TD47 263 aa18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 LRRC29Q8WV35 223 aa18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 TMEM186Q96B77 213 aa18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 SEH1LQ96EE3 360 aa18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 HIF1ANQ9NWT6 349 aa18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 PCDHB10Q9UN67 800 aa18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 DOCK11Q5JSL3 2073 aa18.62■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa18.61■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 SRRM5B3KS81 715 aa18.61■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 RHBDL1O75783 438 aa18.61■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 ZFPL1O95159 310 aa18.61■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 LALBAP00709 142 aa18.61■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 MYF6P23409 242 aa18.61■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 DOC2BQ14184 412 aa18.61■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 IZUMO2Q6UXV1 221 aa18.61■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 ZNF841Q6ZN19 808 aa18.61■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 KCTD8Q6ZWB6 473 aa18.61■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 OR51F2Q8NH61 342 aa18.61■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 POM121Q96HA1 1249 aa18.61■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD60Q9BZ19 345 aa18.61■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 MXRA5Q9NR99 2828 aa18.61■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 PQLC2LA1A4F0 135 aa18.6■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 EFCAB10A6NFE3 127 aa18.6■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 OOEPA6NGQ2 149 aa18.6■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 OR5B21A6NL26 309 aa18.6■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 FCN3O75636 299 aa18.6■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 RIPPLY3P57055 190 aa18.6■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 CR1LQ2VPA4 569 aa18.6■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 DCDC5Q6ZRR9 648 aa18.6■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 FAM90A1Q86YD7 464 aa18.6■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 OR10Z1Q8NGY1 313 aa18.6■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 AQP3Q92482 292 aa18.6■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa18.6■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 VCX3BQ9H321 246 aa18.6■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 MIOXQ9UGB7 285 aa18.6■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 ANKRD61A6NGH8 418 aa18.59■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 A8MXK9 166 aa18.59■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 CPT2P23786 658 aa18.59■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 LCN2P80188 198 aa18.59■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 FAM120AOSQ5T036 256 aa18.59■□□□□ 0.57
SYF2-201ENST00000236273 AHSA2Q719I0 299 aa18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90 ms