RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218879.1

Srp54b-202, Transcript of Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Srp54b, Length 3,642 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Taf13P61216 124 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Htr1fQ02284 366 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Serpine2Q07235 397 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 YrdcQ3U5F4 280 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Zdhhc19Q810M5 347 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Tmem56Q8CGF5 276 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Olfr516Q8VFZ5 314 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 DapQ91XC8 102 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Taf8Q9EQH4 308 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 PcntP48725 2898 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 RnlsA7RDN6 342 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 GlsD3Z7P3 674 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Vmn2r116E9Q6I0 856 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Olfr1471F6QVZ8 314 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Gm20828J3KMI7 228 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Vmn1r168K7N6B6 309 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Olfr1513L7N457 313 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Elovl3O35949 271 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Scg5P12961 212 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 TspoP50637 169 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Aqp2P56402 271 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 UngP97931 306 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Arl14Q3SXC5 192 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Hepacam2Q4VAH7 463 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Nxph2Q61199 261 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Cpeb3Q7TN99 716 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Vtcn1Q7TSP5 283 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Pqlc2Q8C4N4 293 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Srsf4Q8VE97 489 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Olfr1404Q8VGE1 313 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Olfr340Q8VGL0 312 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Pth2Q91W27 100 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Park7Q99LX0 189 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Sft2d3Q9CSV6 209 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 9230112D13RikQ9D260 137 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Q9D8N1 392 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 SerhlQ9EPB5 311 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Slc2a8Q9JIF3 477 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Exo1Q9QZ11 837 aa9.96□□□□□ -0.81
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Plxna3P70208 1872 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Il17dA0A0B4J1G4 205 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Olfr1375A0A0N4SUP0 313 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Gm33543A0A1B0GSI5 81 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Vmn2r86G5E8Y4 848 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Gm14496K7N5U4 849 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Hs3st1O35310 311 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Brs3O54798 399 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Ldb2O55203 373 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Tppp2Q0P5Y3 170 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Olfr1507Q0VEP0 313 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Foxr1Q3UTB7 268 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Spem1Q5F289 310 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Taar6Q5QD13 345 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Orm3Q63805 206 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Olfr1085Q7TR64 313 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 HeltQ7TS99 240 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Ap5m1Q8BJ63 490 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Fam221aQ8C790 301 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Vmn1r226Q8R2A8 298 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Olfr513Q8VFZ3 309 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Olfr1238Q8VG59 315 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Olfr61Q8VGM2 311 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Tspan13Q9D8C2 204 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 CalcrlQ9R1W5 463 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Vmn1r49Q9WUF1 310 aa9.96□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Lipo5F6QKH6 233 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Vmn2r102L7N279 857 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 RorcP51450 516 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Wfdc6aQ3UW55 136 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Utf1Q6J1H4 339 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Olfr594Q7TRR4 311 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Olfr43Q7TRX1 313 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Olfr403Q7TRX2 313 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Sertm1Q8CD78 107 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Znf628Q8CJ78 1038 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Mptx1Q8R1M8 219 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Olfr1388Q8VFA3 311 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 ApofQ91V80 315 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Lysmd1Q9D0E3 226 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Sohlh2Q9D489 467 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Ccdc3Q9D6Y1 273 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Dnajc4Q9D844 244 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Rnf32Q9JIT1 368 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 PorcnQ9JJJ7 461 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Kcnj16Q9Z307 419 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Znf318Q99PP2 2237 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Znf106O88466 1888 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Bclaf3A2AG58 752 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Olfr1158A2BHP7 313 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Gm21981D3Z6Q6 369 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Olfr1329L7MTV4 313 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Atpif1O35143 106 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 H2-AaP01910 256 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 S1pr2P52592 352 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Cd80Q00609 306 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Fstl4Q5STE3 841 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Ifna15Q61718 190 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Olfr298Q7TS06 332 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Ino80cQ8BHA0 191 aa9.95□□□□□ -0.82
Srp54b-202ENSMUST00000218879 Tmem63aQ91YT8 804 aa9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.1 ms