RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639599.1

TARDBP-231, Transcript of TAR DNA binding protein, human

TSL 5

Gene TARDBP, Length 1,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TARDBP-231	ENST00000639599	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	DNTTIP1	Q9H147	329 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	12.1	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		12.1	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A1B0GW55	424 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	SLC22A31	A6NKX4	558 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM183A	A6NL82	134 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	PRR23D1	E9PI22	279 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	GLCE	O94923	617 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	PRR23D2	P0DMB1	279 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	ATP6V1B2	P21281	511 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	ANOS1	P23352	680 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	TGFBR2	P37173	567 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	GABRA2	P47869	451 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	CAPZA1	P52907	286 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	PRDX4	Q13162	271 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	KLHL12	Q53G59	568 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	DUX4L9	Q6RFH8	374 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	WDR86	Q86TI4	376 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF454	Q8N9F8	522 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	RNF170	Q96K19	258 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	PKP2	Q99959	881 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	MED20	Q9H944	212 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599	DUX4	Q9UBX2	424 aa		12.09	□□□□□ -0.47
TARDBP-231	ENST00000639599		H0YAE9	185 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	AKR7A2	O43488	359 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	CLPX	O76031	633 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	GLRA1	P23415	457 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	MAGEA2	P43356	314 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	GNGT1	P63211	74 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	GK3P	Q14409	553 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	STUM	Q69YW2	141 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	RHOU	Q7L0Q8	258 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	KRT77	Q7Z794	578 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	NIPAL2	Q9H841	368 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	NLK	Q9UBE8	527 aa		12.08	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A1W2PPH5	198 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599		M0R1W7	72 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	CSF1	P09603	554 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	OPRL1	P41146	370 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	PROK1	P58294	105 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	KLRD1	Q13241	179 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599		Q6ZSV7	163 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599		Q6ZTK2	550 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	FAM185A	Q8N0U4	392 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	FGFRL1	Q8N441	504 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	GIPC3	Q8TF64	312 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	ITPKC	Q96DU7	683 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	SEH1L	Q96EE3	360 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	PPA2	Q9H2U2	334 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599		A0A0G2JK05	382 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599		B2RBV5	119 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	GSC2	O15499	205 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	ATP8B1	O43520	1251 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	E2F6	O75461	281 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	CST4	P01036	141 aa		12.06	□□□□□ -0.48
TARDBP-231	ENST00000639599	CST1	P01037	141 aa		12.06	□□□□□ -0.48

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