RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 GABRA2P47869 451 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ENTPD1P49961 510 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 BMXP51813 675 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 IL5RAQ01344 420 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF788Q6ZQV5 615 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM86B1Q8N7N1 296 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 OR52L1Q8NGH7 329 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNRF4Q8WWF5 429 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa22.26■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 SIGLEC5O15389 551 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 AKR7A2O43488 359 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 MPIG6BO95866 241 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC15A1P46059 708 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 GRB2P62993 217 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM57BQ71RH2 274 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10Z1Q8NGY1 313 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 SGK3Q96BR1 496 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 TLNRD1Q9H1K6 362 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 SP140LQ9H930 580 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa22.25■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFAB1O14561 156 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC22A2O15244 555 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 CHST1O43916 411 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 GMNNO75496 209 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 COX4I1P13073 169 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 CFL1P23528 166 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 FMO3P31513 532 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 GSK3AP49840 483 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXB2Q5VYV0 432 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 GLYATQ6IB77 296 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 HCP5Q6MZN7 132 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFA11Q86Y39 141 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 FTMTQ8N4E7 242 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF511Q8NB15 262 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM185AQ8NFB2 350 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 MEGF9Q9H1U4 602 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 EGLN3Q9H6Z9 239 aa22.24■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 PEX14O75381 377 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 CAV3P56539 151 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 CGB2Q6NT52 195 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 LIAT1Q6ZQX7 453 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ANGPTL6Q8NI99 470 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 BRD7Q9NPI1 651 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 NLKQ9UBE8 527 aa22.23■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 DHRS12A0PJE2 317 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 GSSP48637 474 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 NUDT2P50583 147 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 CAPZA1P52907 286 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 SNCBQ16143 134 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 AANATQ16613 207 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 CRIP3Q6Q6R5 217 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10A2Q9H208 303 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 RYR3Q15413 4870 aa22.22■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 GYPBP06028 91 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 LGALS4P56470 323 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 MXRA7P84157 204 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPAN31Q12999 210 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 PRDX4Q13162 271 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 PLA1AQ53H76 456 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 MKXQ8IYA7 352 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC37A3Q8NCC5 494 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 OR6K6Q8NGW6 343 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 PGAM5Q96HS1 289 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 AJUBAQ96IF1 538 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF702PQ9H963 129 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 EFCAB1Q9HAE3 211 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 MPC1Q9Y5U8 109 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 CDH10Q9Y6N8 788 aa22.21■■□□□ 1.15
CAPNS1-217ENST00000629983 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM210A6NLX4 147 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2AT4A6NND4 320 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF850A8MQ14 1090 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 CD33P20138 364 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 GLRA1P23415 457 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 COX7A1P24310 79 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNRF1Q8ND25 227 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 OR52H1Q8NGJ2 320 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 MCUR1Q96AQ8 359 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF170Q96K19 258 aa22.2■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 APOC1P02654 83 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 RRM2P31350 389 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL12Q53G59 568 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 C11orf87Q6NUJ2 197 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5M11Q96RB7 305 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 DDOQ99489 341 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 ABCB9Q9NP78 766 aa22.19■■□□□ 1.14
CAPNS1-217ENST00000629983 SERTAD4Q9NUC0 356 aa22.19■■□□□ 1.14
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