RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628904.2

PKP4-217, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PKP4, Length 3,856 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-217ENST00000628904 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 GTF3C1Q12789 2109 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 NOTCH2Q04721 2471 aa6.61□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 A0A0B4J2A0 478 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 A0A1W2PPC1 479 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 GJE1A6NN92 205 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 NPIPB7O75200 414 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 RAF1P04049 648 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 TPOP07202 933 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 GLRA1P23415 457 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 MEOX1P50221 254 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 RAB1AP62820 205 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 PIGYQ3MUY2 71 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 PGAP1Q75T13 922 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 TMEM200AQ86VY9 491 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 C17orf78Q8N4C9 275 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 RNF133Q8WVZ7 376 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 FBXO17Q96EF6 278 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 OR2M2Q96R28 347 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 TGIF2Q9GZN2 237 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 NELFAQ9H3P2 528 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SLC7A10Q9NS82 523 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SHPKQ9UHJ6 478 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 DENND4AQ7Z401 1863 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 AQP7P3A6NL99 342 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SULT1B1O43704 296 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SC5DO75845 299 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 OR4E1P0C645 316 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 S100A1P23297 94 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SOX8P57073 446 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 RAC1P63000 192 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SLC10A1Q14973 349 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 PDSS1Q5T2R2 415 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 OR2T2Q6IF00 324 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ZNF441Q8N8Z8 693 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 OR5L1Q8NGL2 311 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 LILRB4Q8NHJ6 448 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 THAP6Q8TBB0 222 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 DCUN1D4Q92564 292 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 APH1AQ96BI3 265 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SEH1LQ96EE3 360 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 G6PC2Q9NQR9 355 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 H7C417 338 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 AGFG2O95081 481 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 NGFP01138 241 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 LPLP06858 475 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 CD46P15529 392 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 BTCP35070 178 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 IKZF1Q13422 519 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SSPNQ14714 243 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ELMOD2Q8IZ81 293 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SLC43A2Q8N370 569 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 DUSP18Q8NEJ0 188 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 KCNJ15Q99712 375 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 COPZ2Q9P299 210 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 KLK13Q9UKR3 277 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 KCNK7Q9Y2U2 307 aa6.6□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 KLK10O43240 276 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 APOC3P02656 99 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 C1QBP02746 253 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 PTGDSP41222 190 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 LIMK1P53667 647 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 PPP1R1AQ13522 171 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 OPCMLQ14982 345 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 IMMP1LQ96LU5 166 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.357e-7■■■□□ 17.3
PKP4-217ENST00000628904 B8ZZF3 427 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 RAB27BO00194 218 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 NRASP01111 189 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SERPINA7P05543 415 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SKA3Q8IX90 412 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 EXD3Q8N9H8 876 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 OR6X1Q8NH79 312 aa6.59□□□□□ -1.35
PKP4-217ENST00000628904 SLAMF9Q96A28 289 aa6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms