RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNJ15Q99712 375 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 CBR1P16152 277 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 HSD17B12Q53GQ0 312 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 HDHD2Q9H0R4 259 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ATPIF1Q9UII2 106 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 SHISA3A0PJX4 238 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ACHEP22303 614 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 SRP14P37108 136 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 BMXP51813 675 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ARF1P84077 181 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 TAF13Q15543 124 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 SPATC1Q76KD6 591 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 UBASH3BQ8TF42 649 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ACOT12Q8WYK0 555 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 OR14A2Q96R54 314 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 TPK1Q9H3S4 243 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 FBXL3Q9UKT7 428 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 PDCD5O14737 125 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 PIN1P1O15428 100 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 CLEC2LP0C7M8 214 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 SRMP19623 302 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 HSD11B1P28845 292 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 S100A5P33763 92 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ATF6BQ99941 703 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 HMG20AQ9NP66 347 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 HHLA2Q9UM44 414 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 CLDN25C9JDP6 229 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 OCM2P0CE71 109 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ETV6P41212 452 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 PSMD7P51665 324 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 BCL2L15Q5TBC7 163 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF813Q6ZN06 617 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC54Q8NEL0 328 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 OR13C5Q8NGS8 318 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 PLGRKTQ9HBL7 147 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 NOX4Q9NPH5 578 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 AKIP1Q9NQ31 210 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC22A13Q9Y226 551 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 MXD1Q05195 221 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF846Q147U1 533 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 C12orf54Q6X4T0 127 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC16A14Q7RTX9 510 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRC18Q8N456 261 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 SPTSSAQ969W0 71 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 WDFY2Q96P53 400 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 PBOV1Q9GZY1 135 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 SLITRK2Q9H156 845 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 SP140LQ9H930 580 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 NOX3Q9HBY0 568 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 NOTOA8MTQ0 251 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 SGCEO43556 437 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 RAB3BP20337 219 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 CEP78Q5JTW2 689 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM27D1Q5T7N8 215 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 PRSS45Q7RTY3 260 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 MDP1Q86V88 176 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 SKA3Q8IX90 412 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF75AQ96N20 296 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 SH3GL3Q99963 347 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 B3GNT2Q9NY97 397 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-216ENST00000628306 OR6C6A6NF89 314 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 WNT9BO14905 357 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 SYNGR3O43761 229 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 TTRP02766 147 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 CD2P06729 351 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 COX5BP10606 129 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 B4GALT1P15291 398 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 EGR1P18146 543 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 COMPP49747 757 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 ZNF45Q02386 682 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC36A2Q495M3 483 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 MZT2AQ6P582 158 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 DRAM2Q6UX65 266 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC36Q8IYA8 594 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 OR1F12Q8NHA8 337 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 MRI1Q9BV20 369 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 OR2H1Q9GZK4 316 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 PALMDQ9NP74 551 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 PLEK2Q9NYT0 353 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 METRNQ9UJH8 293 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-216ENST00000628306 FOXJ3Q9UPW0 622 aa20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms