RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2T27	Q8NH04	317 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	OR6X1	Q8NH79	312 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	ANGPTL6	Q8NI99	470 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	CNOT9	Q92600	299 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	DAZAP1	Q96EP5	407 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	CFAP36	Q96G28	342 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	TEX37	Q96LM6	180 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	C1orf21	Q9H246	121 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR76	Q9H967	626 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	BRF2	Q9HAW0	419 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	ST6GALNAC1	Q9NSC7	600 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	PEMT	Q9UBM1	199 aa		4.37	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A087WTM6	91 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	MAGEB16	A2A368	324 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	CFAP73	A6NFT4	308 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	MPTX1	A8MV57	137 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440		G3V318	75 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	LSM1	O15116	133 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	PTP4A3	O75365	173 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	COX5B	P10606	129 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	PTPN7	P35236	360 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	MDH1	P40925	334 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	CETN2	P41208	172 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	DYRK1A	Q13627	763 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	SPCS2	Q15005	226 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM69A	Q5T7M9	428 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	TCF24	Q7RTU0	167 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF676	Q8N7Q3	588 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF596	Q8TC21	504 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM120B	Q96EK7	910 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440		Q96M66	194 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	C14orf119	Q9NWQ9	140 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF221	Q9UK13	617 aa		4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	BZW2	Q9Y6E2	419 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440		A0A087WUJ7	227 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM120B	A0PK00	339 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	OOSP1	A8MZH6	123 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	CH25H	O95992	272 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	AK1	P00568	194 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM253	P0C7T8	217 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF728	P0DKX0	622 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	HSD3B1	P14060	373 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB6A	P20340	208 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	GPR4	P46093	362 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	LINC00315	P59091	139 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	CBX1	P83916	185 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR82	Q6UXN9	313 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	OLIG3	Q7RTU3	272 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC16A9	Q7RTY1	509 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	THAP5	Q7Z6K1	395 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A44	Q96H78	314 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440		Q9H3A6	140 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	VIPAS39	Q9H9C1	493 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.35	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	OR6C68	A6NDL8	312 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC28A1	O00337	649 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	RIPK2	O43353	540 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	AIRE	O43918	545 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	MPZL2	O60487	215 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2A4	O95047	310 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV1D-33	P01593	117 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	IGKV1-33	P01594	117 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	ANXA4	P09525	319 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	SOX6	P35712	828 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	SOX2	P48431	317 aa		4.34	□□□□□ -1.71
SNAP23-223	ENST00000627440	ATP6V0D1	P61421	351 aa		4.34	□□□□□ -1.71

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