RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 CLVS2Q5SYC1 327 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PLCXD3Q63HM9 321 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM91Q6ZNR0 172 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 GPR141Q7Z602 305 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 SERPINA12Q8IW75 414 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 OR5D14Q8NGL3 314 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 OR13F1Q8NGS4 319 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 OR13G1Q8NGZ3 307 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 OR8S1Q8NH09 359 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PP6455Q8WZ26 134 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 THRSPQ92748 146 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PIGTQ969N2 578 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ITFG2Q969R8 447 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 C10orf35Q96D05 121 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ORAI1Q96D31 301 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 YIPF6Q96EC8 236 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ELMOD3Q96FG2 381 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 DERL3Q96Q80 235 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CACNG6Q9BXT2 260 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 SLC22A4Q9H015 551 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 OR51E2Q9H255 320 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 LIME1Q9H400 295 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 NOX4Q9NPH5 578 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TAS2R4Q9NYW5 299 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CKLFQ9UBR5 152 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 STUB1Q9UNE7 303 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 MPC1Q9Y5U8 109 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PTPN13Q12923 2485 aa7.25□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ANXA2P2A6NMY6 339 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 C17orf100A8MU93 164 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 F5H5P2 479 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 GPX5O75715 221 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 SC5DO75845 299 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 GATBO75879 557 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV1-46P01743 117 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TNFSF4P23510 183 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CALRP27797 417 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CRYBB2P43320 205 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 UBE2V2Q15819 145 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM42Q69YG0 159 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 C22orf42Q6IC83 251 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PAMR1Q6UXH9 720 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 KRT74Q7RTS7 529 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 NPRL2Q8WTW4 380 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 DIRC2Q96SL1 478 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 FUNDC2Q9BWH2 189 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CHST5Q9GZS9 411 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ABCB9Q9NP78 766 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 SSR3Q9UNL2 185 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ABCA4P78363 2273 aa7.24□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 A0A1B0GWJ7 208 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF732B4DXR9 585 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 H7C417 338 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 PIN1P1O15428 100 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 SULT1B1O43704 296 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 AIREO43918 545 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ARL6IP5O75915 188 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 RAF1P04049 648 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 MAS1P04201 325 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 HCKP08631 526 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 UCHL1P09936 223 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 ATF1P18846 271 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 FSTP19883 344 aa7.23□□□□□ -1.25
SGMS1-211ENST00000626236 RAB3AP20336 220 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms