RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612341.4

SMTN-222, Transcript of smoothelin, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SMTN, Length 3,321 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMTN-222	ENST00000612341	DTX1	Q86Y01	620 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	PIGT	Q969N2	578 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	GPR160	Q9UJ42	338 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	KANTR	A0A1W2PQU2	76 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	CDC14B	O60729	498 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	RPA2	P15927	270 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	ZBTB25	P24278	435 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	CASR	P41180	1078 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM50B	P56557	158 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	LPAL2	Q16609	132 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	SLC25A42	Q86VD7	318 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	SFT2D1	Q8WV19	159 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	PHB2	Q99623	299 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	EDEM2	Q9BV94	578 aa		11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	11.36	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	ABCD4	O14678	606 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	CD37	P11049	281 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	DEFA5	Q01523	94 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	PCOLCE	Q15113	449 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	OR1S1	Q8NH92	325 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	PTX4	Q96A99	478 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	PNRC2	Q9NPJ4	139 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	AQP7P3	A6NL99	342 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	TNFSF11	O14788	317 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	IGHV2-70	P01814	119 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	PNLIP	P16233	465 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	CHAF1B	Q13112	559 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	IKZF1	Q13422	519 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	MRPL14	Q6P1L8	145 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	DKKL1	Q9UK85	242 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	PATE4	P0C8F1	98 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	TMEM88	Q6PEY1	159 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	OR5M9	Q8NGP3	310 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	ELP5	Q8TE02	316 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	BIN3	Q9NQY0	253 aa		11.35	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	DBX1	A6NMT0	343 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	EFS	O43281	561 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	UMOD	P07911	640 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	COX5B	P10606	129 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	SLC35A1	P78382	337 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	OR6K3	Q8NGY3	331 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	CLDN23	Q96B33	292 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	POM121	Q96HA1	1249 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	GLS2	Q9UI32	602 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	ETV2	O00321	342 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	ADAP1	O75689	374 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	MELTF	P08582	738 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	FCGR2A	P12318	317 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	AMY2B	P19961	511 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	SERPINF1	P36955	418 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	KISS1	Q15726	138 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	THAP6	Q8TBB0	222 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	AGTR1	P30556	359 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	OR3A2	P47893	321 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	FGL1	Q08830	312 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	NAXD	Q8IW45	347 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	FOXRED2	Q8IWF2	684 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	LYZL4	Q96KX0	146 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		11.34	□□□□□ -0.59
SMTN-222	ENST00000612341	EXPH5	Q8NEV8	1989 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	MPTX1	A8MV57	137 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	TERT	O14746	1132 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	ZNF205	O95201	554 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	MSR1	P21757	451 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	GABRR1	P24046	479 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	DOK3	Q7L591	496 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	DEFB123	Q8N688	67 aa		11.33	□□□□□ -0.6
SMTN-222	ENST00000612341	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6

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