RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598444.1

ARHGEF1-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene ARHGEF1, Length 425 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF1-215ENST00000598444 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF1-215ENST00000598444 SCCPDHQ8NBX0 429 aa7.32□□□□□ -1.24
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ARHGEF1-215ENST00000598444 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
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ARHGEF1-215ENST00000598444 RNF170Q96K19 258 aa7.32□□□□□ -1.24
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ARHGEF1-215ENST00000598444 RTL8AQ9BWD3 113 aa7.32□□□□□ -1.24
ARHGEF1-215ENST00000598444 TEX12Q9BXU0 123 aa7.32□□□□□ -1.24
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ARHGEF1-215ENST00000598444 ZNF696Q9H7X3 374 aa7.32□□□□□ -1.24
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ARHGEF1-215ENST00000598444 AKR7A2O43488 359 aa7.31□□□□□ -1.24
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ARHGEF1-215ENST00000598444 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.31□□□□□ -1.24
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ARHGEF1-215ENST00000598444 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.31□□□□□ -1.24
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ARHGEF1-215ENST00000598444 SLC2A5P22732 501 aa7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF1-215ENST00000598444 MAP2K3P46734 347 aa7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF1-215ENST00000598444 TGM4P49221 684 aa7.31□□□□□ -1.24
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ARHGEF1-215ENST00000598444 FLOT2Q14254 428 aa7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF1-215ENST00000598444 SNAPC1Q16533 368 aa7.31□□□□□ -1.24
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ARHGEF1-215ENST00000598444 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF1-215ENST00000598444 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF1-215ENST00000598444 TMEM86BQ8N661 226 aa7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF1-215ENST00000598444 KIR3DL3Q8N743 410 aa7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF1-215ENST00000598444 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.31□□□□□ -1.24
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ARHGEF1-215ENST00000598444 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF1-215ENST00000598444 OR10Z1Q8NGY1 313 aa7.31□□□□□ -1.24
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ARHGEF1-215ENST00000598444 YIPF3Q9GZM5 350 aa7.31□□□□□ -1.24
ARHGEF1-215ENST00000598444 SLITRK2Q9H156 845 aa7.31□□□□□ -1.24
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ARHGEF1-215ENST00000598444 PSMD9O00233 223 aa7.3□□□□□ -1.24
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ARHGEF1-215ENST00000598444 DAPP51397 102 aa7.3□□□□□ -1.24
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ARHGEF1-215ENST00000598444 RAG2P55895 527 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF1-215ENST00000598444 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF1-215ENST00000598444 DNAL1Q4LDG9 190 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF1-215ENST00000598444 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF1-215ENST00000598444 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF1-215ENST00000598444 STUMQ69YW2 141 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF1-215ENST00000598444 DEGS2Q6QHC5 323 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF1-215ENST00000598444 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF1-215ENST00000598444 CMTM4Q8IZR5 234 aa7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF1-215ENST00000598444 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ARHGEF1-215ENST00000598444 FAM81AQ8TBF8 368 aa7.3□□□□□ -1.24
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