RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 CXCL12P48061 93 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FXYD6P3P58550 94 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PRPS1P60891 318 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ACTA2P62736 377 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PPIAP62937 165 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP3R1P63098 170 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ACTG2P63267 376 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 IFITM3Q01628 133 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 MXD1Q05195 221 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CRMP1Q14194 572 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 P2RY14Q15391 338 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF74Q16587 644 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TATDN3Q17R31 274 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 DDI2Q5TDH0 399 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 PYHIN1Q6K0P9 492 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 RTL4Q6ZR62 310 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CREB3L2Q70SY1 520 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 LHFPL3Q86UP9 236 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 MARCH9Q86YJ5 346 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SNX29P2Q8IUI4 249 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CCDC36Q8IYA8 594 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ACBD7Q8N6N7 88 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF615Q8N8J6 731 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 BBS1Q8NFJ9 593 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10H4Q8NGA5 316 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 OR51A7Q8NH64 312 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 C8orf46Q8TAG6 207 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 NEIL3Q8TAT5 605 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 HPSE2Q8WWQ2 592 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 DNASE2BQ8WZ79 361 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TM9SF4Q92544 642 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CLDN23Q96B33 292 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TMED9Q9BVK6 235 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 OR51V1Q9H2C8 321 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 C12orf10Q9HB07 376 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 MCCC2Q9HCC0 563 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 UBQLN4Q9NRR5 601 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ICAM5Q9UMF0 924 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAPPC4Q9Y296 219 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC6A5Q9Y345 797 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF337Q9Y3M9 751 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM186AA6NE01 2351 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF318Q5VUA4 2279 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 HEATR5AQ86XA9 2040 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa3.56□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FER1L5A0AVI2 2057 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A1W2PQD3 144 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 MFSD2BA6NFX1 497 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CD8B2A6NJW9 211 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 A8MUA0 341 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 H0YL77 283 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 H3BMH7 237 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 J3QRE1 110 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 IMPA2O14732 288 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 IDH3BO43837 385 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 REM1O75628 298 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 UTS2O95399 124 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 LALBAP00709 142 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SERPINA3P01011 423 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 NGFP01138 241 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 IGHV4-59P01825 116 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 IGKV3-11P04433 115 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 NGFRP08138 427 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM157CP0CG43 387 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 FOSL2P15408 326 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CELP19835 753 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC2A5P22732 501 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 AADACP22760 399 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 F8A1P23610 371 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 MYL9P24844 172 aa3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 RPL4P36578 427 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
CAPNS1-210ENST00000590211 CD79BP40259 229 aa3.55□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms