RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 DOK3Q7L591 496 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRTM1Q86UE6 522 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 C1QL4Q86Z23 238 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ACBD4Q8NC06 268 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 OR52H1Q8NGJ2 320 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 OR5D18Q8NGL1 313 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SYNPRQ8TBG9 265 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR148Q8TDV2 347 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM222BQ8WU58 562 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 HPSE2Q8WWQ2 592 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SPSB4Q96A44 273 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 LIME1Q9H400 295 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 UBTD1Q9HAC8 227 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHA1Q9HB21 404 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CA10Q9NS85 328 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SNTG1Q9NSN8 517 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 TREM2Q9NZC2 230 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 TAAR3PQ9P1P4 343 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SSR3Q9UNL2 185 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SPTA1P02549 2419 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0G2JK05 382 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 A6NNC1 897 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 F5H5P2 479 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 H3BMQ9 156 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SPRY3O43610 288 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 GMDSO60547 372 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ICMTO60725 284 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 LY6HO94772 140 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 TFF1P04155 84 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SOD3P08294 240 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 UCHL1P09936 223 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 COX6B1P14854 86 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ATF1P18846 271 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 GCH1P30793 250 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SDC2P34741 201 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 THBS2P35442 1172 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 RPS19P39019 145 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 MMP15P51511 669 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 GMFBP60983 142 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 PLA2G7Q13093 441 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR50Q13585 617 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 P2RY14Q15391 338 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 OR8B8Q15620 311 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 MST1LQ2TV78 715 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 C3orf36Q3SXR2 165 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF718Q3SXZ3 478 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 HSD17B12Q53GQ0 312 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 HES5Q5TA89 166 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 PLCXD3Q63HM9 321 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CRIP3Q6Q6R5 217 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXW12Q6X9E4 464 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF826PQ6ZT77 177 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ANGPTL5Q86XS5 388 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 DTX3Q8N9I9 347 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 OR1M1Q8NGA1 313 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 OR52N4Q8NGI2 321 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 OR5L1Q8NGL2 311 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 HAVCR1Q96D42 359 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF488Q96MN9 340 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 GAL3ST1Q99999 423 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM204Q9BSN7 226 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 BCL2L14Q9BZR8 327 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 DCSTAMPQ9H295 470 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 NGBQ9NPG2 151 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 DCAF16Q9NXF7 216 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 IQCF6A8MYZ5 107 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF732B4DXR9 585 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 LYNX1G3V0Z9 82 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ANGPTL7O43827 346 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFS7O75251 213 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 NRASP01111 189 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CD1AP06126 327 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 GRPP07492 148 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 HCKP08631 526 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 LYNX1P0DP58 116 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 PRF1P14222 555 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 RAC2P15153 192 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF250P15622 560 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
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