RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560521.5

RABGGTA-217, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-217ENST00000560521 GABRA2P47869 451 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-217ENST00000560521 DGCR2P98153 550 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM3AP98173 230 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-217ENST00000560521 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-217ENST00000560521 SSX2Q16385 188 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC36A3Q495N2 470 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-217ENST00000560521 DNM1P34Q6PK57 102 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-217ENST00000560521 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-217ENST00000560521 ZBTB46Q86UZ6 589 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-217ENST00000560521 OR5K1Q8NHB7 308 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-217ENST00000560521 RPS4Y2Q8TD47 263 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-217ENST00000560521 TFAP2CQ92754 450 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-217ENST00000560521 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-217ENST00000560521 SPTSSAQ969W0 71 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-217ENST00000560521 SPSB4Q96A44 273 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-217ENST00000560521 NMNAT3Q96T66 252 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-217ENST00000560521 ABCB10Q9NRK6 738 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-217ENST00000560521 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGGTA-217ENST00000560521 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 OR2AT4A6NND4 320 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 IFNA14P01570 189 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 ALDOBP05062 364 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 PSG2P11465 335 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 PSKH1P11801 424 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 THBS3P49746 956 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 DYNLT3P51808 116 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 RPS6KA3P51812 740 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 PRKXP51817 358 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC25A1P53007 311 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 IL5RAQ01344 420 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 SPIBQ01892 262 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 KLHL12Q53G59 568 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 DRAM2Q6UX65 266 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 SLC16A9Q7RTY1 509 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 VTCN1Q7Z7D3 282 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 CYB561A3Q8NBI2 242 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 TMEM185AQ8NFB2 350 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 LZICQ8WZA0 190 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 SGK3Q96BR1 496 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 MALSU1Q96EH3 234 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 NDEL1Q9GZM8 345 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 FN3KQ9H479 309 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 SP140LQ9H930 580 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM53CQ9NYF3 392 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 NLKQ9UBE8 527 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF222Q9UK12 451 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 OR6C68A6NDL8 312 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 ODF3BA8MYP8 253 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 XRCC2O43543 280 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 RAMP3O60896 148 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 HLA-DQA2P01906 255 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 IFNW1P05000 195 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 ARG1P05089 322 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 LYL1P12980 280 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 CCL3L1P16619 93 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 GLRA1P23415 457 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 NOS3P29474 1203 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 OMPP47874 163 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM76BQ5HYJ3 339 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 RRM2BQ7LG56 351 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 OR4X2Q8NGF9 303 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 OR4K13Q8NH42 304 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNRF4Q8WWF5 429 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 LYZL4Q96KX0 146 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 C7orf26Q96N11 449 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 PRR25Q96S07 402 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 KCNJ15Q99712 375 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 RABEP2Q9H5N1 569 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 OPA3Q9H6K4 179 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 FAM90A22PA8MWA6 464 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 FXYD1O00168 92 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 TBX1O43435 398 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 RENP00797 406 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 CHATP28329 748 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 DCTDP32321 178 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 GNALP38405 381 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 DLX6P56179 175 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF273Q14593 569 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 AGBL2Q5U5Z8 902 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 ZNF626Q68DY1 528 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 ERICH5Q6P6B1 374 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGGTA-217ENST00000560521 ZDHHC21Q8IVQ6 265 aa7.12□□□□□ -1.27
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