RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551641.5

RAB3IP-215, Transcript of RAB3A interacting protein, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB3IP, Length 2,840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IP-215ENST00000551641 CHST4Q8NCG5 386 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 OR2M3Q8NG83 312 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 OR51E1Q8TCB6 317 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 ST8SIA4Q92187 359 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 FBXW5Q969U6 566 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 PHB2Q99623 299 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 LDAHQ9H6V9 325 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 COMMD9Q9P000 198 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 DUX4Q9UBX2 424 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 RAXQ9Y2V3 346 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 EML6Q6ZMW3 1958 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 C21orf140B9A014 251 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 TRIM77I1YAP6 450 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 IGLV3-1P01715 115 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 CSN2P05814 226 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 C1QTNF9P0C862 333 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 PRKACBP22694 351 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 CTSSP25774 331 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 ADH6P28332 368 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 IL13RA1P78552 427 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 MFAP5Q13361 173 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 DCAF10Q5QP82 559 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 SPINK14Q6IE38 97 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 OXGR1Q96P68 337 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 RASL10BQ96S79 203 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 GPR87Q9BY21 358 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 SELENOIQ9C0D9 397 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 METTL7AQ9H8H3 244 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 IFT46Q9NQC8 304 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 COQ3Q9NZJ6 369 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 ZNF319Q9P2F9 582 aa7.13□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 ZNF814B7Z6K7 855 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 SULT2B1O00204 365 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 LGALS8O00214 317 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 CCSO14618 274 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 ZNF20P17024 532 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 ATP1B3P54709 279 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 TAS2R31P59538 309 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 ACTBL2Q562R1 376 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 PLAC9Q5JTB6 97 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 RNF144BQ7Z419 303 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 NAA40Q86UY6 237 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 STPG2Q8N412 459 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 ARRDC1Q8N5I2 433 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 KCNG3Q8TAE7 436 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 IMMP1LQ96LU5 166 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 NICN1Q9BSH3 213 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 HES7Q9BYE0 225 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 ZNF700Q9H0M5 742 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 AQP7P3A6NL99 342 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 MFNGO00587 321 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 CDC14BO60729 498 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 ABOP16442 354 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 ALDH3B1P43353 468 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 TMEM50BP56557 158 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 ZNF273Q14593 569 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 TAF13Q15543 124 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 FAM189A2Q15884 450 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 Q6ZSR3 168 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 TMEM104Q8NE00 496 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 TMEM185AQ8NFB2 350 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 OR4K15Q8NH41 348 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 SLC22A8Q8TCC7 542 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 ELP5Q8TE02 316 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 SEC22AQ96IW7 307 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 TMEM185BQ9H7F4 350 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.271e-6■■■■□ 24.6
RAB3IP-215ENST00000551641 HPF1Q9NWY4 346 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 CACNA1CQ13936 2221 aa7.12□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 CACNA1BQ00975 2339 aa7.11□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 A0A0B4J2A0 478 aa7.11□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 CRHP06850 196 aa7.11□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 ANOS1P23352 680 aa7.11□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 CDAP32320 146 aa7.11□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 LUMP51884 338 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 BTN1A1Q13410 526 aa7.11□□□□□ -1.27
RAB3IP-215ENST00000551641 EXT1Q16394 746 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51 ms