RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513284.5

RNF4-218, Transcript of ring finger protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene RNF4, Length 517 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF4-218ENST00000513284 GORASP2Q9H8Y8 452 aa9.02□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 SP140LQ9H930 580 aa9.02□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 RAB18Q9NP72 206 aa9.02□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 C14orf119Q9NWQ9 140 aa9.02□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa9.02□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 A6NLC8 198 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 E9PQ18 207 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 DCTN6O00399 190 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 XRCC2O43543 280 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 DIRAS1O95057 198 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 FABP3P05413 133 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 DDOSTP39656 456 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 FXYD6P3P58550 94 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 IKZF1Q13422 519 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 DOC2BQ14184 412 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 SEC23BQ15437 767 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 SNCBQ16143 134 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 DRAM2Q6UX65 266 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 DTX3Q8N9I9 347 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 SDR9C7Q8NEX9 313 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 PROKR2Q8NFJ6 384 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 OR5AU1Q8NGC0 362 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 MUC7Q8TAX7 377 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 C7orf34Q96L11 122 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 NSMCE2Q96MF7 247 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 COPS4Q9BT78 406 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 MUC13Q9H3R2 512 aa9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 STARD9Q9P2P6 4700 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 A6NDX4 124 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 NKX6-3A6NJ46 265 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 M0R1W7 72 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 NDUFB3O43676 98 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 KRT36O76013 467 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 APOC1P02654 83 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 RRM2P31350 389 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 SLC15A1P46059 708 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 BLVRAP53004 296 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 GYS2P54840 703 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 ZNF92Q03936 586 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 TSPAN31Q12999 210 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 DGUOKQ16854 277 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 DMRTC1Q5HYR2 192 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 NCR3LG1Q68D85 454 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 LIAT1Q6ZQX7 453 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 C11orf42Q8N5U0 333 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 FAM86B1Q8N7N1 296 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 LINC00482Q8N8I6 264 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 OR8S1Q8NH09 359 aa9□□□□□ -0.97
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RNF4-218ENST00000513284 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 NDE1Q9NXR1 346 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 V9GYQ6 96 aa9□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 OR6C68A6NDL8 312 aa8.99□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa8.99□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 BHLHE40O14503 412 aa8.99□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 ANGPTL7O43827 346 aa8.99□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 TIPRLO75663 272 aa8.99□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 CHRM2P08172 466 aa8.99□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 CCDC159P0C7I6 412 aa8.99□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 PF4V1P10720 104 aa8.99□□□□□ -0.97
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RNF4-218ENST00000513284 FMO3P31513 532 aa8.99□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 GSSP48637 474 aa8.99□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 ERVFRD-1P60508 538 aa8.99□□□□□ -0.97
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RNF4-218ENST00000513284 SNAI3Q3KNW1 292 aa8.99□□□□□ -0.97
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RNF4-218ENST00000513284 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa8.99□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa8.99□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 STUMQ69YW2 141 aa8.99□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 CCDC121Q6ZUS5 278 aa8.99□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa8.99□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 PIGWQ7Z7B1 504 aa8.99□□□□□ -0.97
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RNF4-218ENST00000513284 TMEM219Q86XT9 240 aa8.99□□□□□ -0.97
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RNF4-218ENST00000513284 FTMTQ8N4E7 242 aa8.99□□□□□ -0.97
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RNF4-218ENST00000513284 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 KCNJ15Q99712 375 aa8.99□□□□□ -0.97
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RNF4-218ENST00000513284 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa8.99□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 CD300AQ9UGN4 299 aa8.99□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 BAIAP2Q9UQB8 552 aa8.99□□□□□ -0.97
RNF4-218ENST00000513284 CDH10Q9Y6N8 788 aa8.99□□□□□ -0.97
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