RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF581Q9P0T4 197 aa1.74□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 CLEC4EQ9ULY5 219 aa1.74□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 TSC2P49815 1807 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF233A6NK53 670 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 MBTPS2O43462 519 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 SH3BGRLO75368 114 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 SERF1AO75920 110 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 FGGP02679 453 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 SCGB1A1P11684 91 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 PSKH1P11801 424 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 PGAM2P15259 253 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 RAB5AP20339 215 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 SLC2A5P22732 501 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 HTR2CP28335 458 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 SERPINB1P30740 379 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ACTBP60709 375 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ACTA2P62736 377 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ACTG1P63261 375 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ACTG2P63267 376 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ACTC1P68032 377 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ACTA1P68133 377 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 STX3Q13277 289 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 NAB1Q13506 487 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 CLINT1Q14677 625 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 SMCO1Q147U7 214 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 PSG5Q15238 335 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 OR4D1Q15615 310 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ATP6AP1Q15904 470 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ATP6V1FQ16864 119 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 CASC10Q5T4H9 136 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 FRMPD2BQ6IN97 320 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF546Q86UE3 836 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 CRLF3Q8IUI8 442 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 UBALD2Q8IYN6 164 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 PRELID2Q8N945 189 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 NOXO1Q8NFA2 376 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 OR1N2Q8NGR9 330 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 OR10R2Q8NGX6 335 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 CDS1Q92903 461 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 NEIL2Q969S2 332 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 RPEQ96AT9 228 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 RCN3Q96D15 328 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 B3GALT6Q96L58 329 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF597Q96LX8 424 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 TSC22D3Q99576 134 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 AGMATQ9BSE5 352 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 BBS2Q9BXC9 721 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 SRRQ9GZT4 340 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 WDR54Q9H977 334 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 UGT1A7Q9HAW7 530 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ABCB10Q9NRK6 738 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 CMTM6Q9NX76 183 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 MS4A12Q9NXJ0 267 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 BABAM2Q9NXR7 383 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 CALYQ9NYX4 217 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 UVRAGQ9P2Y5 699 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 XCL2Q9UBD3 114 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 GGA2Q9UJY4 613 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ACOT9Q9Y305 439 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 LRRC42Q9Y546 428 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ASTN1O14525 1302 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 A0A0A6YYD5 115 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 CLIC3O95833 236 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 CD3GP09693 182 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 LINC00614P0C842 121 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 OR1E1P30953 314 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 CAPZBP47756 277 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 RPL14P50914 215 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 RIPPLY3P57055 190 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 CXCR4P61073 352 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 TIMM10P62072 90 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 SEMG2Q02383 582 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ECH1Q13011 328 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 POU6F1Q14863 301 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 OR7A5Q15622 319 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 CEACAM21Q3KPI0 293 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 ACTBL2Q562R1 376 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 NHLRC3Q5JS37 347 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 DUPD1Q68J44 220 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 C19orf35Q6ZS72 473 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC121Q6ZUS5 278 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 SSX7Q7RTT5 188 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 PAGE2Q7Z2X7 111 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 NT5DC3Q86UY8 548 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa1.73□□□□□ -2.13
PDE4D-218ENST00000509368 FAM86B1Q8N7N1 296 aa1.73□□□□□ -2.13
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