RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 NDUFB2O95178 105 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 RENP00797 406 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 CHATP28329 748 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 RPS6KA3P51812 740 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 SLC25A1P53007 311 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 RAB25P57735 213 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 RPL31P62899 125 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 PRKCDQ05655 676 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 NFYCQ13952 458 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 TRAM2Q15035 370 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 TAF13Q15543 124 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 SNCBQ16143 134 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 SSX2Q16385 188 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 DGUOKQ16854 277 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 VMACQ2NL98 169 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 SLC18B1Q6NT16 456 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 DRAM2Q6UX65 266 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 DLEU7Q6UYE1 221 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ZNF788Q6ZQV5 615 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 KCTD8Q6ZWB6 473 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 FAM122BQ7Z309 247 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 FTMTQ8N4E7 242 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 OR13D1Q8NGV5 346 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 OR5K1Q8NHB7 308 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 MALSU1Q96EH3 234 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 TPD52L3Q96J77 140 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 PRR25Q96S07 402 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 COPS4Q9BT78 406 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 RTL8AQ9BWD3 113 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ZMAT4Q9H898 229 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 MRGBPQ9NV56 204 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 USE1Q9NZ43 259 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ADA2Q9NZK5 511 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 NLKQ9UBE8 527 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 TMEM5Q9Y2B1 443 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 LRP12Q9Y561 859 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 RYR2Q92736 4967 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 OR2AT4A6NND4 320 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 CDC42EP2O14613 210 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 SLC22A2O15244 555 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 AKR7A2O43488 359 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 LY86O95711 162 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 FAM107AO95990 144 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 LPLP06858 475 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ZNF823P16415 610 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 AMY2BP19961 511 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 GLRA1P23415 457 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 CFL1P23528 166 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 SLC6A1P30531 599 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 MYCNOSP40205 109 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ECI1P42126 302 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 THBS3P49746 956 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ARHGDIBP52566 201 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 SLC34A1Q06495 639 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 KLF10Q13118 480 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 SELPLGQ14242 412 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 MAPRE2Q15555 327 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 TIGD6Q17RP2 521 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ABCA11PQ4W5N1 156 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 Q6ZS46 218 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 PTCHD4Q6ZW05 846 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 C16orf82Q7Z2V1 217 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 WDR86Q86TI4 376 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 C11orf53Q8IXP5 236 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 OFCC1Q8IZS5 231 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ZNRF1Q8ND25 227 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 SLC26A10Q8NG04 563 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 OR10Z1Q8NGY1 313 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ANGPTL6Q8NI99 470 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 NDNFQ8TB73 568 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 TSPEARQ8WU66 669 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ISOC1Q96CN7 298 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 TSSK2Q96PF2 358 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 WDR13Q9H1Z4 485 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 C1orf21Q9H246 121 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 KAT8Q9H7Z6 458 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ABCB9Q9NP78 766 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 NRIP3Q9NQ35 241 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 RHCGQ9UBD6 479 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 KCNG2Q9UJ96 466 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 A4GNTQ9UNA3 340 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa4.93□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa4.92□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 PSMB11A5LHX3 300 aa4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms