RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-240ENST00000495293 PPA1Q15181 289 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 BEX5Q5H9J7 111 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 RNLSQ5VYX0 342 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TMEM53Q6P2H8 277 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 NIPAL3Q6P499 406 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 PET117Q6UWS5 81 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TFAP2EQ6VUC0 442 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 STAC2Q6ZMT1 411 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 CREB3L2Q70SY1 520 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 HDDC2Q7Z4H3 204 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 NANOGNBQ7Z5D8 188 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 CADM3Q8N126 398 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 GABRG1Q8N1C3 465 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 GPR137CQ8N3F9 429 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 CLDN22Q8N7P3 220 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 GDPD1Q8N9F7 314 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 ACBD4Q8NC06 268 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 GPR32P1Q8NGA4 272 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 OR52L1Q8NGH7 329 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 OR5J2Q8NH18 312 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 GRPEL2Q8TAA5 225 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TMEM239Q8WW34 195 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TAAR8Q969N4 342 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TMEM45BQ96B21 275 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 S100PBPQ96BU1 408 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 PIK3IP1Q96FE7 263 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 ELMOD3Q96FG2 381 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 DIRAS2Q96HU8 199 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 LRR1Q96L50 414 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 LURAP1Q96LR2 239 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 PRRC1Q96M27 445 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 KCNN2Q9H2S1 579 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 PLK3Q9H4B4 646 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 RERGLQ9H628 205 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 FKRPQ9H9S5 495 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 ISYNA1Q9NPH2 558 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 FKBP14Q9NWM8 211 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TAS2R16Q9NYV7 291 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 HECTD1Q9ULT8 2610 aa3.9□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 LOC100509620A0A075B734 347 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 A0A1W2PRG6 482 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 CBY3A6NI87 242 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 FTCDNL1E5RQL4 147 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 C11orf98E9PRG8 122 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 ORC5O43913 435 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 PRKYO43930 277 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 RAD51DO75771 328 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 SERPINI2O75830 405 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TPPPO94811 219 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 IGF2P01344 180 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 IFNGP01579 166 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 BGLAPP02818 100 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 HLA-DPB1P04440 258 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 HOXB5P09067 269 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TRAPPC2P0DI81 140 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TRAPPC2BP0DI82 140 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 SAGP10523 405 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 NR2C1P13056 603 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 IFI30P13284 250 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TMEM11P17152 192 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 FUT1P19526 365 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 IGHV1-2P23083 117 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 CFL1P23528 166 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 GABRA5P31644 462 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TNFSF8P32971 234 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 ETV6P41212 452 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 SLC9A3P48764 834 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 CDH11P55287 796 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 BPIFB3P59826 476 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 PRPS1P60891 318 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 MXD1Q05195 221 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 PUDPQ08623 228 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 RIPPLY1Q0D2K3 151 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TRAM1Q15629 374 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 KCNJ8Q15842 424 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 ZNF74Q16587 644 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 TIMM23BQ5SRD1 257 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 SLC25A30Q5SVS4 291 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 C9orf135Q5VTT2 229 aa3.89□□□□□ -1.79
RBM39-240ENST00000495293 AGAP6Q5VW22 663 aa3.89□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms