RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481211.1

NISCH-208, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 557 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-208ENST00000481211 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 TMEM210A6NLX4 147 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 PDCD5O14737 125 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 SLC22A1O15245 554 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 TMEM127O75204 238 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 CD55P08174 381 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 ATF1P18846 271 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 SRMP19623 302 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 CA6P23280 308 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 CALRP27797 417 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 MTNR1BP49286 362 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 ZNF81P51508 661 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 FUT6P51993 359 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 OR8G1Q15617 311 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 MST1LQ2TV78 715 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 PLCXD3Q63HM9 321 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 C22orf42Q6IC83 251 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 TMEM200AQ86VY9 491 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 LRP11Q86VZ4 500 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 OR5AS1Q8N127 324 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 BHLHE23Q8NDY6 225 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 OR1M1Q8NGA1 313 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 OR8S1Q8NH09 359 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 ITPKCQ96DU7 683 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 RTL8AQ9BWD3 113 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 UBTD1Q9HAC8 227 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 DYNLRB1Q9NP97 96 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 TMEM138Q9NPI0 162 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 PLCE1Q9P212 2302 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 A0A1W2PPR1 153 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 ZNF850A8MQ14 1090 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 C17orf100A8MU93 164 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 H3BSH0 61 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 PIN1P1O15428 100 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 PRF1P14222 555 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 BDKRB2P30411 391 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 CD200P41217 278 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 SRP9P49458 86 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 GNG3P63215 75 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 TESK1Q15569 626 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 CTF1Q16619 201 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 ALKBH6Q3KRA9 238 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 TMEM255AQ5JRV8 349 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 C11orf71Q6IPW1 123 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 OR13C9Q8NGT0 318 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 OR5P3Q8WZ94 311 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 ERGIC1Q969X5 290 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 MARVELD3Q96A59 401 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 EGLN1Q9GZT9 426 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 FAM192AQ9GZU8 254 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 CXXC4Q9H2H0 198 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 TAS2R4Q9NYW5 299 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 IL19Q9UHD0 177 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 ICE1Q9Y2F5 2266 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 H7C417 338 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 LMX1BO60663 402 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 LILRA1O75019 489 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 IL1AP01583 271 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 MAGEB1P43366 347 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 RBP2P50120 134 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 ATP1B3P54709 279 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 PRSS12P56730 875 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 INSL4Q14641 139 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 UBE2V2Q15819 145 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 FAM76BQ5HYJ3 339 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 GLT8D1Q68CQ7 371 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 Q6ZR03 302 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 USP43Q70EL4 1123 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 MOB3CQ70IA8 216 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 CROCCP3Q8IVE0 287 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 ELMOD3Q96FG2 381 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 BORCS8Q96FH0 119 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 UQCC2Q9BRT2 126 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 CENPOQ9BU64 300 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 RAB1BQ9H0U4 201 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 GPR173Q9NS66 373 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 CEPT1Q9Y6K0 416 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 PKDREJQ9NTG1 2253 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-208ENST00000481211 A0A1W2PPK0 400 aa11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms