RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	EME1	Q96AY2	570 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ABCB9	Q9NP78	766 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM36	Q9NQ86	728 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880		R4GMQ9	66 aa		12.37	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3OR16-10	A0A075B7F0	116 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0U1RQV5	110 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ACOD1	A6NK06	481 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880		A8MXK9	166 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	P2RY10	O00398	339 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	FAH	P16930	419 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF12	P17014	697 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	THBS2	P35442	1172 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	GPM6A	P51674	278 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	EFNB1	P98172	346 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	EGR3	Q06889	387 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	RIPPLY1	Q0D2K3	151 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	MICB	Q29980	383 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	SSX6	Q7RTT6	188 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2F	Q969M7	185 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ITPKC	Q96DU7	683 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	SLC6A7	Q99884	636 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	C19orf24	Q9BVV8	132 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	USE1	Q9NZ43	259 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	OPN4	Q9UHM6	478 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ENPP5	Q9UJA9	477 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	GNG8	Q9UK08	70 aa		12.36	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880		A6NIN4	97 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF732	B4DXR9	585 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	TMPRSS2	O15393	492 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ENTPD6	O75354	484 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	CST4	P01036	141 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	OR2T7	P0C7T2	308 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	FPR2	P25090	351 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	DCTD	P32321	178 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	WDR25	Q64LD2	544 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	WDR82	Q6UXN9	313 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	PQLC1	Q8N2U9	271 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	OR2T27	Q8NH04	317 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ST8SIA4	Q92187	359 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	RNFT2	Q96EX2	444 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ADI1	Q9BV57	179 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	RNPEPL1	Q9HAU8	725 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	HAO2	Q9NYQ3	351 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	AASS	Q9UDR5	926 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		12.35	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GVI7	797 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	METTL15	A6NJ78	407 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM210	A6NLX4	147 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	AKR7A2	O43488	359 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	TTR	P02766	147 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	PSMB10	P40306	273 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	MTNR1A	P48039	350 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	TP53I3	Q53FA7	332 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	RBMS3	Q6XE24	437 aa	Known RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	SEH1L	Q96EE3	360 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	CCL13	Q99616	98 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	MS4A7	Q9GZW8	240 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	GPR173	Q9NS66	373 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	ZKSCAN7	Q9P0L1	754 aa	Predicted RBP	12.34	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	CTSZ	Q9UBR2	303 aa		12.34	□□□□□ -0.43
SSR4-208	ENST00000471880	DAPL1	A0PJW8	107 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	SNTN	A6NMZ2	147 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFA2	O43678	99 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	12.33	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	DHRS3	O75911	302 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	FSTL3	O95633	263 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	NRAS	P01111	189 aa		12.33	□□□□□ -0.44
SSR4-208	ENST00000471880	ATP6V1B1	P15313	513 aa		12.33	□□□□□ -0.44

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