RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467246.5

HPS1-208, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HPS1, Length 2,791 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-208ENST00000467246 GPR87Q9BY21 358 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 UPB1Q9UBR1 384 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 OPN4Q9UHM6 478 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 MED13Q9UHV7 2174 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 PLSCR5A0PG75 271 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 LINC00862A6NCI5 91 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 STMND1H3BQB6 276 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 SYNGR3O43761 229 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 CHRM2P08172 466 aa10□□□□□ -0.81
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HPS1-208ENST00000467246 HRH1P35367 487 aa10□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 CASRP41180 1078 aa10□□□□□ -0.81
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HPS1-208ENST00000467246 CEACAM16Q2WEN9 425 aa10□□□□□ -0.81
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HPS1-208ENST00000467246 AKR7LQ8NHP1 331 aa10□□□□□ -0.81
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HPS1-208ENST00000467246 RAB3CQ96E17 227 aa10□□□□□ -0.81
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HPS1-208ENST00000467246 IFT46Q9NQC8 304 aa10□□□□□ -0.81
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HPS1-208ENST00000467246 C21orf140B9A014 251 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 DISC1C4P0D8 188 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 RAD51DO75771 328 aa9.99□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 SCGNO76038 276 aa9.99□□□□□ -0.81
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HPS1-208ENST00000467246 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
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HPS1-208ENST00000467246 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 PP6455Q8WZ26 134 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 GPR35Q9HC97 309 aa9.98□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 TOR1AO14656 332 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 LCATP04180 440 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 SERPINA2P20848 420 aa9.97□□□□□ -0.81
HPS1-208ENST00000467246 IL32P24001 234 aa9.97□□□□□ -0.81
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