RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463189.1

TTC31-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 31, human

TSL 3

Gene TTC31, Length 894 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC31-208	ENST00000463189	SLC6A6	P31641	620 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	PRSS12	P56730	875 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	OR8G1	Q15617	311 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	SNAPC1	Q16533	368 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	MEP1B	Q16820	701 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	CORO6	Q6QEF8	472 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	IQCF1	Q8N6M8	205 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	PLPP7	Q8NBV4	271 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	OR2T33	Q8NG76	320 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	ATF6B	Q99941	703 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	C16orf95	Q9H693	158 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		13.43	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	C5orf63	A6NC05	138 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	OOEP	A6NGQ2	149 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	SNTN	A6NMZ2	147 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	C3orf80	F5H4A9	247 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	TXNDC12	O95881	172 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	SMIM18	P0DKX4	95 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	GRK5	P34947	590 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	ECH1	Q13011	328 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	OR8B8	Q15620	311 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	SFRP4	Q6FHJ7	346 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	DHRS7B	Q6IAN0	325 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	DPY19L2P2	Q6ZN68	376 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	CFAP77	Q6ZQR2	320 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189		Q6ZSV7	163 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	PGAP1	Q75T13	922 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	ADAT1	Q9BUB4	502 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	IFT27	Q9BW83	186 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	IER3IP1	Q9Y5U9	82 aa		13.42	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	PTGES3L	E9PB15	166 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189		F5H5K5	113 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	DCTN6	O00399	190 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	GMDS	O60547	372 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	PTP4A3	O75365	173 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	WBP4	O75554	376 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	ECD	O95905	644 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	CENPA	P49450	140 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	APOF	Q13790	326 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	FBLN7	Q53RD9	439 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	MRPL21	Q7Z2W9	205 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	TSSK2	Q96PF2	358 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	PLCXD1	Q9NUJ7	323 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	AASS	Q9UDR5	926 aa		13.41	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189		A0A1B0GVI7	797 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	BTBD17	A6NE02	478 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189		M0R129	80 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	XPNPEP2	O43895	674 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	PPP1R3D	O95685	299 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	LCAT	P04180	440 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	CSF1	P09603	554 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	CA6	P23280	308 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	FXYD6P3	P58550	94 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	ARF6	P62330	175 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	CDON	Q4KMG0	1287 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	ZNF773	Q6PK81	442 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	BTN2A1	Q7KYR7	527 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	PIP4P2	Q8N4L2	257 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	SLC26A10	Q8NG04	563 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	TMEM163	Q8TC26	289 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	APH1B	Q8WW43	257 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	MYDGF	Q969H8	173 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	KPTN	Q9Y664	436 aa		13.4	□□□□□ -0.26
TTC31-208	ENST00000463189	RIIAD1	A6NNX1	92 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTC31-208	ENST00000463189	CD300LB	A8K4G0	201 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTC31-208	ENST00000463189	RGS10	O43665	173 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTC31-208	ENST00000463189	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TTC31-208	ENST00000463189	TSPAN9	O75954	239 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTC31-208	ENST00000463189	IFNG	P01579	166 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTC31-208	ENST00000463189	GYPA	P02724	150 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTC31-208	ENST00000463189	FBP1	P09467	338 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTC31-208	ENST00000463189	GABRB1	P18505	474 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTC31-208	ENST00000463189	NOS3	P29474	1203 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTC31-208	ENST00000463189	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TTC31-208	ENST00000463189	TPTE	P56180	551 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTC31-208	ENST00000463189	SMN1	Q16637	294 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TTC31-208	ENST00000463189	LAIR2	Q6ISS4	152 aa		13.39	□□□□□ -0.27
TTC31-208	ENST00000463189	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
TTC31-208	ENST00000463189	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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