RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 COX6A1P12074 109 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 SNU13P55769 128 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 OR9K2Q8NGE7 335 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 PLEK2Q9NYT0 353 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 EHFQ9NZC4 300 aa14.87□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 TNFSF11O14788 317 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 ZIC3O60481 467 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 DHRS3O75911 302 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 CCL4P13236 92 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 LIFP15018 202 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 SSR4P51571 173 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 IL11RAQ14626 422 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 TMEM17Q86X19 198 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 TMEM185AQ8NFB2 350 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 OR13G1Q8NGZ3 307 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 TMEM54Q969K7 222 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 NABP1Q96AH0 204 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 PHYHIPLQ96FC7 376 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 PILRBQ9UKJ0 227 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 MPTX1A8MV57 137 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 DHHO43323 396 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 SFT2D2O95562 160 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 PRF1P14222 555 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 CTSSP25774 331 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 THBS4P35443 961 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 CBX5P45973 191 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 ARHGDIBP52566 201 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 PPIAP62937 165 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 C10orf128Q5T292 105 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 CRIP3Q6Q6R5 217 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 FAM219AQ8IW50 185 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 IMMP1LQ96LU5 166 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 CDC6Q99741 560 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 ANGPTL4Q9BY76 406 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 ULBP2Q9BZM5 246 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 NMES1Q9C002 83 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 PROK2Q9HC23 129 aa14.86□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 M0R135 149 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 HPNP05981 417 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 GLRA1P23415 457 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 FPR2P25090 351 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 CYCSP99999 105 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 DEFA5Q01523 94 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 EXT1Q16394 746 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 MYO7BQ6PIF6 2116 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 ATRAIDQ6UW56 229 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 FAM89BQ8N5H3 189 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 ZNF799Q96GE5 643 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 PECRQ9BY49 303 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 ZNF700Q9H0M5 742 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 GLS2Q9UI32 602 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 V9GYS6 101 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 A0A0U1RQV5 110 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 C9J4A7 227 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 BET1O15155 118 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 CD63P08962 238 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 GABRR1P24046 479 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 ANKRD55Q3KP44 614 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 AADACL3Q5VUY0 350 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 PMS2CLQ68D20 193 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 TFAP2EQ6VUC0 442 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 TMEM123Q8N131 208 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 BPIFCQ8NFQ6 507 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 OR5AP2Q8NGF4 316 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 SCGB3A2Q96PL1 93 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 RNF126Q9BV68 326 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 HPF1Q9NWY4 346 aa14.85□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 A0A0B4J2A0 478 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 A0A0J9YW62 118 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 VAMP5O95183 116 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 IGLV3-1P01715 115 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 CYC1P08574 325 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 SNAI3Q3KNW1 292 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 LHFPL5Q8TAF8 219 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 FBXO17Q96EF6 278 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 CHST5Q9GZS9 411 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 DNTTIP1Q9H147 329 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 C12orf4Q9NQ89 552 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 ASF1BQ9NVP2 202 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 GHRLQ9UBU3 117 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 SHPKQ9UHJ6 478 aa14.84□□□□□ -0.03
ACTB-207ENST00000462494 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms