RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437322.2

USP27X-AS1-201, Transcript of USP27X antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP27X-AS1, Length 2,175 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 HHLA2Q9UM44 414 aa15.2■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CSAG2Q9Y5P2 127 aa15.2■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RAB27BO00194 218 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPP1P10451 314 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LIFP15018 202 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TBPP20226 339 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC6A9P48067 706 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DNASE1L1P49184 302 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MST1LQ2TV78 715 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NKAPLQ5M9Q1 402 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C1orf140Q5VVS0 124 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR10K2Q6IF99 312 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IGF2-ASQ6U949 168 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZNF519Q8TB69 540 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SFT2D1Q8WV19 159 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 WNT2BQ93097 391 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ACKR4Q9NPB9 350 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR6A2O95222 327 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ISG15P05161 165 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPARCP09486 303 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FOLR2P14207 255 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GPR85P60893 370 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 JAGN1Q8N5M9 183 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DCUN1D4Q92564 292 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC25A36Q96CQ1 311 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MRGPRX4Q96LA9 322 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ABHD6Q9BV23 337 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SELENOIQ9C0D9 397 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PTGES2Q9H7Z7 377 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TREM1Q9NP99 234 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LRP12Q9Y561 859 aa15.19■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LYL1P12980 280 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ITGA3P26006 1051 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SERPINF1P36955 418 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TAS2R31P59538 309 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SPOCK1Q08629 439 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PDZK1IP1Q13113 114 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR7A5Q15622 319 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC25A53Q5H9E4 307 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KCTD9Q7L273 389 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ACBD4Q8NC06 268 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 POC1BQ8TC44 478 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RXFP4Q8TDU9 374 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CASTOR1Q8WTX7 329 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NTNG2Q96CW9 530 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 R4GMQ9 66 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C5orf51A6NDU8 294 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AHSA1O95433 338 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MT-ATP6P00846 226 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 IL11P20809 199 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RPL27P61353 136 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OTPQ5XKR4 325 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 AWAT2Q6E213 333 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 C5orf46Q6UWT4 87 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 VASH2Q86V25 355 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR4D6Q8NGJ1 314 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR13C3Q8NGS6 347 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FAM46BQ96A09 425 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RNF122Q9H9V4 155 aa15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SLC16A7O60669 478 aa15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 DXOO77932 396 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 VAMP1P23763 118 aa15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KCNJ3P48549 501 aa15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NHLH1Q02575 133 aa15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EIF2B1Q14232 305 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 OR52N5Q8NH56 324 aa15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 TMED6Q8WW62 240 aa15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NRIP2Q9BQI9 281 aa15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 FANCFQ9NPI8 374 aa15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LPAR3Q9UBY5 353 aa15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 MED12Q93074 2177 aa15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 LOC100509620A0A075B734 347 aa15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 KCNAB3O43448 404 aa15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 EFNA2O43921 213 aa15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 SCGNO76038 276 aa15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 F10P00742 488 aa15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 P04436 131 aa15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 PAX6P26367 422 aa15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 CYB561P49447 251 aa15.17■□□□□ 0.02
USP27X-AS1-201ENST00000437322 GSK3AP49840 483 aa15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms