RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 MEOX2P50222 304 aa3.17□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM3AP98173 230 aa3.17□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ACY1Q03154 408 aa3.17□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A45Q8N413 288 aa3.17□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SMRP1Q8NCR6 262 aa3.17□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 METTL21AQ8WXB1 218 aa3.17□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 OR8D2Q9GZM6 311 aa3.17□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 IKZF2Q9UKS7 526 aa3.17□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF115Q9Y4L5 304 aa3.17□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa3.17□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PI3P19957 117 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 DLSTP36957 453 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXW4P57775 412 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MC2RQ01718 297 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF283Q8N7M2 679 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SYT3Q9BQG1 590 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 NUDT19A8MXV4 375 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 WNT2P09544 360 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC6A8P48029 635 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 Q6ZS49 121 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB11FIP2Q7L804 512 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 C5orf24Q7Z6I8 188 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PRR22Q8IZ63 422 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 OR8B12Q8NGG6 310 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SLAMF6Q96DU3 332 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRG7Q96K78 797 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PBOV1Q9GZY1 135 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 UBE2QL1A1L167 161 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RER1O15258 196 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CDC14BO60729 498 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 C1QL1O75973 258 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 NAPSAO96009 420 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 DANCRP0C864 163 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PRKACAP17612 351 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS23P62266 143 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM244Q5VVB8 128 aa3.16□□□□□ -1.9
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PGGT1B-203ENST00000419445 C5orf46Q6UWT4 87 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CDC6Q99741 560 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CHST5Q9GZS9 411 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LMAN1LQ9HAT1 526 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SERPINA5P05154 406 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 HPNP05981 417 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 THEGLP0DJG4 465 aa3.16□□□□□ -1.9
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PGGT1B-203ENST00000419445 TGIF1Q15583 401 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 EXT1Q16394 746 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RD3Q7Z3Z2 195 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SVBPQ8N300 66 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC22A24Q8N4F4 322 aa3.16□□□□□ -1.9
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PGGT1B-203ENST00000419445 OR8S1Q8NH09 359 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SEC61A2Q9H9S3 476 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CRIM1Q9NZV1 1036 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 RFNGQ9Y644 331 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 SPTBN4Q9H254 2564 aa3.16□□□□□ -1.9
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PGGT1B-203ENST00000419445 C4orf46Q504U0 113 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 PCSK4Q6UW60 755 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CD163Q86VB7 1156 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ANGPTL4Q9BY76 406 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CSAG2Q9Y5P2 127 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 CD34P28906 385 aa3.16□□□□□ -1.9
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PGGT1B-203ENST00000419445 PYY3Q5JQD4 70 aa3.16□□□□□ -1.9
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PGGT1B-203ENST00000419445 PYGO2Q9BRQ0 406 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 MMP26Q9NRE1 261 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 ACACAQ13085 2346 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 HCRTR2O43614 444 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 IFNA4P05014 189 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 LAP3P28838 519 aa3.16□□□□□ -1.9
PGGT1B-203ENST00000419445 OR3A4PP47883 348 aa3.16□□□□□ -1.9
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