RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 OR7D2Q96RA2 312 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 ICAM5Q9UMF0 924 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 LAMA3Q16787 3333 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 BRCA2P51587 3418 aa6.03□□□□□ -1.44
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1W2PQF6 199 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 C21orf140B9A014 251 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 J3QLI3 93 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC35G6P0C7Q6 338 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 TFPIP10646 304 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 ADRA1AP35348 466 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC16A1P53985 500 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 TCL1AP56279 114 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 POM121L1PQ3SYA9 428 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 TIGITQ495A1 244 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 DTX1Q86Y01 620 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 NUDT8Q8WV74 236 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 APH1AQ96BI3 265 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 DUSP16Q9BY84 665 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A19Q9HC21 320 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 FGF21Q9NSA1 209 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 MEIS3P2A8K0S8 358 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 GNB3P16520 340 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 CD33P20138 364 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 BMP5P22003 454 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 GPX3P22352 226 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 OR10A3P58181 314 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 ARSIQ5FYB1 569 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 TIMM23BQ5SRD1 257 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 LGI3Q8N145 548 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 REPS2Q8NFH8 660 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 PNPLA2Q96AD5 504 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 VSTM2LQ96N03 204 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC46A2Q9BY10 475 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 LMAN1LQ9HAT1 526 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 GPR35Q9HC97 309 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 SLC9A2Q9UBY0 812 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 ASPDHA6ND91 283 aa6.02□□□□□ -1.45
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RABGEF1-202ENST00000380828 MSGN1A6NI15 193 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 RS1O15537 224 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 ACTL6BO94805 426 aa6.02□□□□□ -1.45
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RABGEF1-202ENST00000380828 PGA4P0DJD7 388 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 PGA5P0DJD9 388 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 SRD5A2P31213 254 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 GABRA4P48169 554 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 UCNP55089 124 aa6.02□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.02□□□□□ -1.45
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RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF549Q6P9A3 640 aa6.02□□□□□ -1.45
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RABGEF1-202ENST00000380828 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.02□□□□□ -1.45
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RABGEF1-202ENST00000380828 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa6.01□□□□□ -1.45
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RABGEF1-202ENST00000380828 HCRTO43612 131 aa6.01□□□□□ -1.45
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RABGEF1-202ENST00000380828 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 IL13RA1P78552 427 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 ZNF684Q5T5D7 378 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 CST9LP1Q5W188 147 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 CNIH2Q6PI25 160 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 DTWD1Q8N5C7 304 aa6.01□□□□□ -1.45
RABGEF1-202ENST00000380828 TMEM174Q8WUU8 243 aa6.01□□□□□ -1.45
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