RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311626.8

HOXB3-201, Transcript of homeobox B3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 2,642 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-201ENST00000311626 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 ACKR4Q9NPB9 350 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 SFT2D2O95562 160 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 PNLIPP16233 465 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 CSNK1A1P48729 337 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 AADACL3Q5VUY0 350 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 A0A1B0GW55 424 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 TOR1AO14656 332 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 DUX4L2P0CJ85 424 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 DUX4L3P0CJ86 424 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 DUX4L4P0CJ87 422 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 DUX4L5P0CJ88 424 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 DUX4L6P0CJ89 424 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 DUX4L7P0CJ90 424 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 CXCL12P48061 93 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 FADS6Q8N9I5 356 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 DUX4Q9UBX2 424 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 GPR31O00270 319 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 TBPP20226 339 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 GABRR1P24046 479 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 C6orf201Q7Z4U5 140 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 TMEM17Q86X19 198 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 MARC2Q969Z3 335 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 GLS2Q9UI32 602 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 PIGLQ9Y2B2 252 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 NAT1P18440 290 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 STARD6P59095 220 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 TAS2R31P59538 309 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 NKAPLQ5M9Q1 402 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 VAX1Q5SQQ9 334 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 OCSTAMPQ9BR26 566 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 CYTL1Q9NRR1 136 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 F12P00748 615 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 CCL1P22362 96 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 SLC35A1P78382 337 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 PCOLCEQ15113 449 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 OR2AE1Q8NHA4 323 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 SSC4DQ8WTU2 575 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 CDC6Q99741 560 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 PECRQ9BY49 303 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 LHX6Q9UPM6 363 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 S100A10P60903 97 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 GRB2P62993 217 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 RAB32Q13637 225 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 TMEM88Q6PEY1 159 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 SLC39A1Q9NY26 324 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 MSR1P21757 451 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 CHAF1BQ13112 559 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 SNAI3Q3KNW1 292 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 NMES1Q9C002 83 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 DNTTIP1Q9H147 329 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 GPR173Q9NS66 373 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 ANAPC10Q9UM13 185 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 ANGPTL7O43827 346 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 ACTL6AO96019 429 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 SFTPBP07988 381 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 ICAM2P13598 275 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 KCNMB1Q16558 191 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 GUCA2BQ16661 112 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 ARRDC1Q8N5I2 433 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 PHYHIPLQ96FC7 376 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 ABCD4O14678 606 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 PATE4P0C8F1 98 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXB3-201ENST00000311626 CTRB1P17538 263 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 ECH1Q13011 328 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 CTRB2Q6GPI1 263 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 ZNF585AQ6P3V2 769 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 PLEK2Q9NYT0 353 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 OSGIN2Q9Y236 505 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 NPIPA2E9PIF3 369 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 NPIPA3F8WFD2 350 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 TNFSF11O14788 317 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 TSPAN9O75954 239 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 ADCYAP1P18509 176 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 BRICD5Q6PL45 260 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 BAP18Q8IXM2 172 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 NABP1Q96AH0 204 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXB3-201ENST00000311626 TP53I11O14683 189 aa22.19■■□□□ 1.14
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