RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 SNCBQ16143 134 aa16.13■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 TIGD4Q8IY51 512 aa16.13■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGAP24Q8N264 748 aa16.13■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 FTMTQ8N4E7 242 aa16.13■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 DMRTB1Q96MA1 342 aa16.13■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 DCTN5Q9BTE1 182 aa16.13■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 RTL8AQ9BWD3 113 aa16.13■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 OR51V1Q9H2C8 321 aa16.13■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa16.13■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 RGCCQ9H4X1 137 aa16.13■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 SNTG1Q9NSN8 517 aa16.13■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 HAO2Q9NYQ3 351 aa16.13■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 MPC1Q9Y5U8 109 aa16.13■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 SELLP14151 372 aa16.12■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 PRDX4Q13162 271 aa16.12■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC10Q5BKY1 277 aa16.12■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 STUMQ69YW2 141 aa16.12■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa16.12■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 LRTOMTQ8WZ04 291 aa16.12■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 FEVQ99581 238 aa16.12■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 WDR13Q9H1Z4 485 aa16.12■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 DNAJB11Q9UBS4 358 aa16.12■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF850A8MQ14 1090 aa16.11■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 CLPXO76031 633 aa16.11■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 LYNP07948 512 aa16.11■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 FBP1P09467 338 aa16.11■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 PAICSP22234 425 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 ACKR3P25106 362 aa16.11■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 PROK1P58294 105 aa16.11■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 GUCA2AQ02747 115 aa16.11■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 TAF9Q16594 264 aa16.11■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 ASPHD2Q6ICH7 369 aa16.11■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 Q8N7P7 452 aa16.11■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 OR10Z1Q8NGY1 313 aa16.11■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 OTOSQ8NHW6 89 aa16.11■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 GIPC3Q8TF64 312 aa16.11■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 NPRL2Q8WTW4 380 aa16.11■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 THEM6Q8WUY1 208 aa16.11■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 OR5P3Q8WZ94 311 aa16.11■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 NSL1Q96IY1 281 aa16.11■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 MMP27Q9H306 513 aa16.11■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 ZNRD1Q9P1U0 126 aa16.11■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1W2PRD5 423 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1W2PRF3 423 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1W2PRM7 423 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM210A6NLX4 147 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 SELENOFO60613 162 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 CST4P01036 141 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 EEF1B2P24534 225 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 DLX1P56177 255 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 PLBD1Q6P4A8 553 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 Q6ZSV7 163 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 KCTD8Q6ZWB6 473 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 C8orf46Q8TAG6 207 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 PIGCQ92535 297 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 RNF170Q96K19 258 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 PKP2Q99959 881 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 DNTTIP1Q9H147 329 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 ABCB9Q9NP78 766 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF391Q9UJN7 358 aa16.1■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 BTBD17A6NE02 478 aa16.09■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 NKX6-3A6NJ46 265 aa16.09■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 NPFFO15130 113 aa16.09■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 AKR7A2O43488 359 aa16.09■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 CST1P01037 141 aa16.09■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 TFF1P04155 84 aa16.09■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 RAP2AP10114 183 aa16.09■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 POU1F1P28069 291 aa16.09■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 KLRD1Q13241 179 aa16.09■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 GK3PQ14409 553 aa16.09■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF788Q6ZQV5 615 aa16.09■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF454Q8N9F8 522 aa16.09■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 MED30Q96HR3 178 aa16.09■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 LYZL4Q96KX0 146 aa16.09■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 GAFA1Q96PS6 74 aa16.09■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 TAS2R1Q9NYW7 299 aa16.09■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 VPREB3Q9UKI3 123 aa16.09■□□□□ 0.17
CXCL3-201ENST00000296026 ARRDC5A6NEK1 342 aa16.08■□□□□ 0.16
CXCL3-201ENST00000296026 GINS1Q14691 196 aa16.08■□□□□ 0.16
CXCL3-201ENST00000296026 DGUOKQ16854 277 aa16.08■□□□□ 0.16
CXCL3-201ENST00000296026 FAM76BQ5HYJ3 339 aa16.08■□□□□ 0.16
CXCL3-201ENST00000296026 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
CXCL3-201ENST00000296026 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa16.08■□□□□ 0.16
CXCL3-201ENST00000296026 OR8B12Q8NGG6 310 aa16.08■□□□□ 0.16
CXCL3-201ENST00000296026 ANGPTL6Q8NI99 470 aa16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms