RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 F5H5P2 479 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 H3BSH0 61 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 SSX4O60224 188 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 LMX1BO60663 402 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 CSF3P09919 207 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 DAOP14920 347 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 CRYBB2P43320 205 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ART1P52961 327 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 MZT1Q08AG7 82 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 TPBGQ13641 420 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 SPRNQ5BIV9 151 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 Q5PR19 223 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 UBE2UQ5VVX9 321 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 OR13C3Q8NGS6 347 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 OR8S1Q8NH09 359 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 GPR148Q8TDV2 347 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 HPSE2Q8WWQ2 592 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 PP6455Q8WZ26 134 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 OR5P3Q8WZ94 311 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 FCGR1BQ92637 280 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 RDH5Q92781 318 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 OPALINQ96PE5 141 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 TECTBQ96PL2 329 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 MGLLQ99685 303 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 C14orf119Q9NWQ9 140 aa11.21□□□□□ -0.61
CCDC42-201ENST00000293845 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 ANKRD61A6NGH8 418 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 OR5B21A6NL26 309 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 RP2O75695 350 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 GATBO75879 557 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 NRASP01111 189 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 DSCR9P59020 149 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 UTS2BQ765I0 119 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 PARP16Q8N5Y8 322 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF525Q8N782 197 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 UFD1Q92890 307 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 ERGIC1Q969X5 290 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 MICU1Q9BPX6 476 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 RTL8AQ9BWD3 113 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 DLL4Q9NR61 685 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 DHDHQ9UQ10 334 aa11.2□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 CREBBPQ92793 2442 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 AKAP9Q99996 3911 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 A6NIN4 97 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM210A6NLX4 147 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 CD2P06729 351 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 HSMCR30P0CW71 290 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 CPEP16870 476 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF20P17024 532 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 PDLIM4P50479 330 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF181Q2M3W8 571 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 CEACAM21Q3KPI0 293 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 Q499Y3 187 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 FAM76BQ5HYJ3 339 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 PLCXD3Q63HM9 321 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 WDR86Q86TI4 376 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 MS4A15Q8N5U1 240 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 OR5A2Q8NGI9 324 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 Q8TCH9 128 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 YIPF5Q969M3 257 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 FGGYQ96C11 551 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 TLNRD1Q9H1K6 362 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 CHODLQ9H9P2 273 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 GCM1Q9NP62 436 aa11.19□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 A0A087WXM4 84 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 TRIM64CA6NLI5 447 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 IFNL4K9M1U5 179 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 NDUFS8O00217 210 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 ALX3O95076 343 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 SERPINA3P01011 423 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 OCM2P0CE71 109 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 COL8A2P25067 703 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 GIFP27352 417 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 THBS2P35442 1172 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 GNG3P63215 75 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF154Q13106 437 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 UBE2V2Q15819 145 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 CLEC12BQ2HXU8 276 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 CEP78Q5JTW2 689 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 LIPKQ5VXJ0 399 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 CLEC2AQ6UVW9 174 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 MOB3CQ70IA8 216 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 SERPINA12Q8IW75 414 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 PHC2Q8IXK0 858 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 TSPAN14Q8NG11 270 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 OR1M1Q8NGA1 313 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 OR13C5Q8NGS8 318 aa11.18□□□□□ -0.62
CCDC42-201ENST00000293845 THRSPQ92748 146 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms