RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 ZNHIT1O43257 154 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 RSU1Q15404 277 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 ANKRD55Q3KP44 614 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 C7orf61Q8IZ16 206 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 TM4SF19Q96DZ7 209 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 KLHDC7BQ96G42 594 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 SLC5A6Q9Y289 635 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 PLRG1O43660 514 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 ANGPTL7O43827 346 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 EIF4E2O60573 245 aaKnown RBP13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 SULT1A1P50225 295 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 ZNF260Q3ZCT1 412 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 UEVLDQ8IX04 471 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 ZNF442Q9H7R0 627 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 WBP1LQ9NX94 342 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 ZNF727A8MUV8 499 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 CDRT15L2A8MXV6 281 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 PPP1R2P9O14990 202 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 CHRM2P08172 466 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 ZNF43P17038 809 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 ACER2Q5QJU3 275 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 FGF14Q92915 247 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 CTHRC1Q96CG8 243 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 PRRX2Q99811 253 aa13.61□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 NUDT19A8MXV4 375 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 GPR3P46089 330 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 TAS2R46P59540 309 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 HSF1Q00613 529 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 C6orf201Q7Z4U5 140 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 TMEM123Q8N131 208 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 C15orf54Q8N8G6 183 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 RER1O15258 196 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 CYB5BO43169 146 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 CST4P01036 141 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 QDPRP09417 244 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 OR1J1Q8NGS3 322 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 OR2G3Q8NGZ4 309 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 A0A0U1RQK1 487 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 A0A1B0GTI1 187 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 A6NIZ1 184 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 AP4M1O00189 453 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 SMIM10L1P0DMW3 83 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 PIGPP57054 158 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 SLC37A1P57057 533 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 MLF1P58340 268 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 RAP1BP61224 184 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 PRAMEF20Q5VT98 475 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 HAS2Q92819 552 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 SMIM10Q96HG1 83 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 SLC46A1Q96NT5 459 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 SOX7Q9BT81 388 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 OR51B6Q9H340 312 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 C5orf66Q9H5L9 145 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 LANCL2Q9NS86 450 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 KLF15Q9UIH9 416 aa13.6□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 A0A1W2PR80 420 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 OR5K4A6NMS3 321 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 H3BP45 60 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 ZNF735P0CB33 412 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 COL9A1P20849 921 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 BLKP51451 505 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 APCDD1LQ8NCL9 501 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 SSX3Q99909 188 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 RAB18Q9NP72 206 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 PADI1Q9ULC6 663 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 PQLC2LA1A4F0 135 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 ZNF84P51523 738 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 RRADP55042 308 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 ZNF813Q6ZN06 617 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 NMES1Q9C002 83 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 CRLF2Q9HC73 371 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 PLEK2Q9NYT0 353 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 SPTA1P02549 2419 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 A0A0G2JNG1 304 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 KIR2DS3K7RE56 304 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 HSPA12AO43301 675 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 BPNT1O95861 308 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 FAHP16930 419 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 FBLP22087 321 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 ALDH3B1P43353 468 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 HSD17B7P56937 341 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 KIR2DS5Q14953 304 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 ZNF684Q5T5D7 378 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 C9orf135Q5VTT2 229 aa13.59□□□□□ -0.23
USP25-201ENST00000285679 MEGF10Q96KG7 1140 aa13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms