RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 RIBC2Q9H4K1 309 aa9.88□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 EMC7Q9NPA0 242 aa9.88□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 VNN3Q9NY84 501 aa9.88□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 NDUFAF4Q9P032 175 aa9.88□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 ZNRD1Q9P1U0 126 aa9.88□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 ENPP4Q9Y6X5 453 aa9.88□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 A0A1B0GVI7 797 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 IQCF6A8MYZ5 107 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 LGALS8O00214 317 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 TNFRSF11BO00300 401 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 ADAM20O43506 726 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 FAM20BO75063 409 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 CDK1P06493 297 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 ETV6P41212 452 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 BCAP31P51572 246 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 PPP5CP53041 499 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 ZNF45Q02386 682 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 AQP6Q13520 282 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 CDONQ4KMG0 1287 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 SLC25A30Q5SVS4 291 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 MEDAGQ5VYS4 303 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 EGFL6Q8IUX8 553 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 HS3ST5Q8IZT8 346 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 CENPSQ8N2Z9 138 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 C11orf44Q8N8P7 122 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 DTX3Q8N9I9 347 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 BHLHE23Q8NDY6 225 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 OR4D11Q8NGI4 311 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 TMEM239Q8WW34 195 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 CFHR4Q92496 578 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 DHRS1Q96LJ7 313 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 Q96MT0 163 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 HCAR1Q9BXC0 346 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 PPA2Q9H2U2 334 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 CNTD2Q9H8S5 307 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 SP140LQ9H930 580 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 C20orf141Q9NUB4 165 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 RNF7Q9UBF6 113 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 CTSZQ9UBR2 303 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 MED31Q9Y3C7 131 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 KPTNQ9Y664 436 aa9.87□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 A0A1B0GWJ7 208 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 FUOMA2VDF0 154 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 HTR3EA5X5Y0 456 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 PTGES3LE9PB15 166 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 WBP4O75554 376 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 INMTO95050 263 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 PAHP00439 452 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 HLA-DPB1P04440 258 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 SCG5P05408 212 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 PRKACGP22612 351 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 EFNB2P52799 333 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 TAS2R41P59536 307 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 CTXN1P60606 82 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 CDC42P60953 191 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 GUCA2AQ02747 115 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 MAB21L1Q13394 359 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 IRF3Q14653 427 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 SPCS2Q15005 226 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 TRIM16LQ309B1 348 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 BTN2A1Q7KYR7 527 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 ZNF367Q7RTV3 350 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 VMO1Q7Z5L0 202 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 NKAIN4Q8IVV8 208 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 OR10G2Q8NGC3 310 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 OR1F12Q8NHA8 337 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 TMEM255BQ8WV15 326 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 SLC7A6Q92536 515 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 ITFG2Q969R8 447 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 PHF21AQ96BD5 680 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 LGALS12Q96DT0 336 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 COPS4Q9BT78 406 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 DGCR6LQ9BY27 220 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 CCDC90BQ9GZT6 254 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 FN3KRPQ9HA64 309 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 UFSP2Q9NUQ7 469 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 ATPIF1Q9UII2 106 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 HIF3AQ9Y2N7 669 aa9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 OR6C6A6NF89 314 aa9.85□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 MPIG6BO95866 241 aa9.85□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 MT-ND2P03891 347 aa9.85□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 GABRB1P18505 474 aa9.85□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 OPRL1P41146 370 aa9.85□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 CD200P41217 278 aa9.85□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 KIR2DS4P43632 304 aa9.85□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 CRYBA2P53672 197 aa9.85□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 PRKCDQ05655 676 aa9.85□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 OR8B8Q15620 311 aa9.85□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
SPC25-201ENST00000282074 CD300LDQ6UXZ3 194 aa9.85□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms