RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 KISS1Q15726 138 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 OGFOD3Q6PK18 319 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 MOB3CQ70IA8 216 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM156Q8N614 296 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 PIK3IP1Q96FE7 263 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 TAF9BQ9HBM6 251 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 SLC17A5Q9NRA2 495 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 NPIPB7O75200 414 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 LCATP04180 440 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 GPR85P60893 370 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 OR5L1Q8NGL2 311 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 RHOFQ9HBH0 211 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 PIAS2O75928 621 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 FHITP49789 147 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 MMP16P51512 607 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 SPIN3Q5JUX0 258 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 C5orf24Q7Z6I8 188 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 SULF2Q8IWU5 870 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 SLC25A45Q8N413 288 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 OR10Z1Q8NGY1 313 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 NEK7Q8TDX7 302 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 C12orf57Q99622 126 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 SULT4A1Q9BR01 284 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 RNF126Q9BV68 326 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 OR51B6Q9H340 312 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 NBEAQ8NFP9 2946 aa11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 LILRA5A6NI73 299 aa11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 FTCDNL1E5RQL4 147 aa11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 NPIPA2E9PIF3 369 aa11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 NPIPA3F8WFD2 350 aa11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 PCK2Q16822 640 aa11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 MFSD8Q8NHS3 518 aa11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 BPNT1O95861 308 aa11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 CFIP05156 583 aa11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 C1orf100Q5SVJ3 147 aa11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 GUSBP11Q6P575 273 aa11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 ESX1Q8N693 406 aa11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 APCDD1LQ8NCL9 501 aa11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 OR13G1Q8NGZ3 307 aa11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 SLAMF9Q96A28 289 aa11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 C14orf79Q96F83 325 aa11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 WNT16Q9UBV4 365 aa11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 AMDHD2Q9Y303 409 aa11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 MUC3AQ02505 3323 aa11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 K7EPK0 472 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 CD74P04233 296 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 MECP2P51608 486 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 ACY1Q03154 408 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 RSU1Q15404 277 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 FDX2Q6P4F2 183 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 ANKRD37Q7Z713 158 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 OR56B1Q8NGI3 324 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 SECTM1Q8WVN6 248 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 BCL2L14Q9BZR8 327 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 EDARQ9UNE0 448 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 R4GN57 208 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1B0GTI1 187 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 ADCYAP1P18509 176 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 RFC3P40938 356 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 CSNK1A1P48729 337 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 CLINT1Q14677 625 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 PEA15Q15121 130 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF576Q9H609 170 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 ANKUB1A6NFN9 424 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 IFNA21P01568 189 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 CD8AP01732 235 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 SPP1P10451 314 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 SCAND1P57086 179 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 LPCAT3Q6P1A2 487 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 Q6ZRG5 221 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 AKR7LQ8NHP1 331 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 FNDC9Q8TBE3 224 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 MR1Q95460 341 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 RSRP1Q9BUV0 290 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 C3orf80F5H4A9 247 aa11.8□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 CRYBA1P05813 215 aa11.8□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.6 ms