RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239367.6

LRP11-201, Transcript of LDL receptor related protein 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRP11, Length 3,260 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP11-201ENST00000239367 RAMP1O60894 148 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 HLA-DOBP13765 273 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 HGFACQ04756 655 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 UNC119Q13432 240 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 LURAP1Q96LR2 239 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 SLC5A7Q9GZV3 580 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 FANCMQ8IYD8 2048 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 CYB5BO43169 146 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 MT-ATP6P00846 226 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 ZNF20P17024 532 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 RPL27P61353 136 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 ZNF124Q15973 351 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 PARM1Q6UWI2 310 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 ZDHHC22Q8N966 263 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 ZNF519Q8TB69 540 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 C2orf50Q96LR7 162 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 NELFAQ9H3P2 528 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 A0A087X0M5 115 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 A0A1B0GX30 115 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 ZNF726A6NNF4 738 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 CDRT15L2A8MXV6 281 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 BCKDHBP21953 392 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 CHAF1BQ13112 559 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 DBX2Q6ZNG2 339 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 FGF14Q92915 247 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa14.54□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 BTBD17A6NE02 478 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 IL2RAP01589 272 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 HHEXQ03014 270 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 SGCBQ16585 318 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 PLXDC2Q6UX71 529 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 LRP11Q86VZ4 500 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 SUMF1Q8NBK3 374 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 FAHD2AQ96GK7 314 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 SMIM8Q96KF7 97 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 ATG101Q9BSB4 218 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 NMES1Q9C002 83 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 C17orf105B2RV13 164 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 SLC34A2O95436 690 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 SFT2D2O95562 160 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 CD5P06127 495 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 SLC37A1P57057 533 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 UBE2KP61086 200 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 NAAAQ02083 359 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 ZDHHC12Q96GR4 267 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 MRGPRX1Q96LB2 322 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 SLC46A1Q96NT5 459 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 MED29Q9NX70 200 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 ISG15P05161 165 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 HKR1P10072 659 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 BTNL8Q6UX41 500 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 NKAIN3Q8N8D7 197 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 FNDC9Q8TBE3 224 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 AQP3Q92482 292 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 TMEM230Q96A57 120 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 C14orf144Q96I85 54 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 TREM2Q9NZC2 230 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 MEMO1Q9Y316 297 aa14.53□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa14.52□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 AHSA1O95433 338 aa14.52□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 PET100P0DJ07 73 aa14.52□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 PAX6P26367 422 aa14.52□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 RABIFP47224 123 aa14.52□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 SNU13P55769 128 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 CHRFAM7AQ494W8 412 aa14.52□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 KLHL24Q6TFL4 600 aa14.52□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 OR56B1Q8NGI3 324 aa14.52□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 OR1J1Q8NGS3 322 aa14.52□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 C5orf34Q96MH7 638 aa14.52□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 TXNIPQ9H3M7 391 aa14.52□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa14.52□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
LRP11-201ENST00000239367 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
LRP11-201ENST00000239367 FRG2CA6NGY1 282 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP11-201ENST00000239367 PPP1R2P9O14990 202 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP11-201ENST00000239367 SOX15O60248 233 aa14.52□□□□□ -0.09
LRP11-201ENST00000239367 HTR5AP47898 357 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms