RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP20.17■□□□□ 0.82
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ANKRD54-201ENST00000215941 MALSU1Q96EH3 234 aa20.17■□□□□ 0.82
ANKRD54-201ENST00000215941 OR51M1Q9H341 326 aa20.17■□□□□ 0.82
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ANKRD54-201ENST00000215941 OR1N1Q8NGS0 311 aa20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-201ENST00000215941 SHDQ96IW2 340 aa20.16■□□□□ 0.82
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ANKRD54-201ENST00000215941 ANKUB1A6NFN9 424 aa20.15■□□□□ 0.82
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ANKRD54-201ENST00000215941 RAD51DO75771 328 aa20.15■□□□□ 0.82
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ANKRD54-201ENST00000215941 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
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ANKRD54-201ENST00000215941 THEM4Q5T1C6 240 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-201ENST00000215941 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-201ENST00000215941 OR51E1Q8TCB6 317 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-201ENST00000215941 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-201ENST00000215941 ARL5BQ96KC2 179 aa20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-201ENST00000215941 RPS10P5Q9NQ39 176 aa20.15■□□□□ 0.82
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ANKRD54-201ENST00000215941 A0A1W2PNV4 684 aa20.15■□□□□ 0.82
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ANKRD54-201ENST00000215941 C9JQL5 133 aa20.15■□□□□ 0.82
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ANKRD54-201ENST00000215941 LMO7DNF2Z398 122 aa20.14■□□□□ 0.81
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ANKRD54-201ENST00000215941 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 FNDC9Q8TBE3 224 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 PRRX2Q99811 253 aa20.14■□□□□ 0.81
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ANKRD54-201ENST00000215941 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa20.14■□□□□ 0.81
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ANKRD54-201ENST00000215941 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 IFNA21P01568 189 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 IGHV2-5P01817 119 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 SFTPBP07988 381 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 HOXB5P09067 269 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 PI3P19957 117 aa20.13■□□□□ 0.81
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ANKRD54-201ENST00000215941 RHEBQ15382 184 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 DOK3Q7L591 496 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ALKBH4Q9NXW9 302 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 ADAM10O14672 748 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 RRP8O43159 456 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 HCKP08631 526 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 OR8U9P0C7N5 309 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 THBS4P35443 961 aa20.12■□□□□ 0.81
ANKRD54-201ENST00000215941 C14orf28Q4W4Y0 310 aa20.12■□□□□ 0.81
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