RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	BEX1	Q9HBH7	125 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	RETN	Q9HD89	108 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	POLR3H	Q9Y535	204 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	NUMA1	Q14980	2115 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	ABCA7	Q8IZY2	2146 aa		4.09	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	KNL1	Q8NG31	2342 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	EML5	Q05BV3	1969 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	SMIM31	A0A1B0GVY4	71 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	IDS	B3KWA1	339 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	C11orf98	E9PRG8	122 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	PRKY	O43930	277 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	TPST1	O60507	370 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC19A2	O60779	497 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	PRSS2	P07478	247 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	HOXD4	P09016	255 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	MGMT	P16455	207 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	CTRB1	P17538	263 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	COX5A	P20674	150 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR1	P46091	355 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	PRKX	P51817	358 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	OR4D2	P58180	307 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	CHRNB3	Q05901	458 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	GABRA6	Q16445	453 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	TNXA	Q16473	311 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF691	Q5VV52	312 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	CBR4	Q8N4T8	237 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	FNDC8	Q8TC99	324 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	POP5	Q969H6	163 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	NEIL2	Q969S2	332 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	COX14	Q96I36	57 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	ITCH	Q96J02	903 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	BMF	Q96LC9	184 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	RNF145	Q96MT1	663 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	UGT2B28	Q9BY64	529 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	CLMP	Q9H6B4	373 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	REEP4	Q9H6H4	257 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	C6orf106	Q9H6K1	298 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	IL1RAP	Q9NPH3	570 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		4.08	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616		A0A096LPI6	279 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	SPTY2D1-AS1	A0A0U1RR47	76 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC5A10	A0PJK1	596 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	EVPLL	A8MZ36	301 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	XRCC2	O43543	280 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	PSIP1	O75475	530 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	HSBP1	O75506	76 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	SOD1	P00441	154 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	GGT1	P19440	569 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	PRPS1L1	P21108	318 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	FCGR2C	P31995	323 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	LEP	P41159	167 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	CRYBA2	P53672	197 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	MTPN	P58546	118 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF154	Q13106	437 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	ATP6AP1	Q15904	470 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	BCL2A1	Q16548	175 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	APOOL	Q6UXV4	268 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF621	Q6ZSS3	439 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	PGAP1	Q75T13	922 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	LACC1	Q8IV20	430 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	OR10A6	Q8NH74	314 aa		4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	TFG	Q92734	400 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
EFHC1-223	ENST00000636616	TESC	Q96BS2	214 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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