RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 FBP1P09467 338 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 CLUP10909 449 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 CX3CR1P49238 355 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 HSP90B2PQ58FF3 399 aa20.48■□□□□ 0.87
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PTPRF-216ENST00000617451 SEH1LQ96EE3 360 aa20.48■□□□□ 0.87
PTPRF-216ENST00000617451 CDRT15Q96T59 188 aa20.48■□□□□ 0.87
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PTPRF-216ENST00000617451 SNCBQ16143 134 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRF-216ENST00000617451 GFOD2Q3B7J2 385 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRF-216ENST00000617451 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRF-216ENST00000617451 OR10Z1Q8NGY1 313 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRF-216ENST00000617451 OR6N2Q8NGY6 317 aa20.42■□□□□ 0.86
PTPRF-216ENST00000617451 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
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