RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 ARL9Q6T311 187 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 DPY19L4Q7Z388 723 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 LRP11Q86VZ4 500 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 GPR137CQ8N3F9 429 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 IL17RDQ8NFM7 739 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 RAB39BQ96DA2 213 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF649Q9BS31 505 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 LINC00470Q9BZP3 86 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 GPR35Q9HC97 309 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 GLTPQ9NZD2 209 aa14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 CLPXO76031 633 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 NAT2P11245 290 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ALOX5APP20292 161 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 RIDAP52758 137 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 NCS1P62166 190 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 BAMBIQ13145 260 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 FBLN7Q53RD9 439 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 MDP1Q86V88 176 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC26A10Q8NG04 563 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 PHYHIPQ92561 330 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 NSMAFQ92636 917 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMED9Q9BVK6 235 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ULBP2Q9BZM5 246 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 FZR1Q9UM11 496 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 A3GALT2U3KPV4 340 aa14.91□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 DCTN6O00399 190 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 OGG1O15527 345 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 CDC14BO60729 498 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ARL6IP5O75915 188 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 IL1AP01583 271 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 QDPRP09417 244 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 GATA3P23771 443 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 MYL9P24844 172 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 S100A5P33763 92 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 CRYBB2P43320 205 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC3A1Q07837 685 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 C20orf196Q8IYI0 205 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF679Q8IYX0 411 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 S100ZQ8WXG8 99 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 AP3S1Q92572 193 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM203Q969S6 136 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 MCHR2Q969V1 340 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 SMIM19Q96E16 107 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 MMP27Q9H306 513 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 NIPAL2Q9H841 368 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF69Q9UC07 566 aa14.9□□□□□ -0.02
TRAPPC3-209ENST00000616395 GATBO75879 557 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 IGHV2-5P01817 119 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 MAGEB1P43366 347 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 GDI2P50395 445 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 RORCP51449 518 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 HCCSP53701 268 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 CDK5R1Q15078 307 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 HIST3H3Q16695 136 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 RHOUQ7L0Q8 258 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 C1QL4Q86Z23 238 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 CROCCP3Q8IVE0 287 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 NDNFQ8TB73 568 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNRF4Q8WWF5 429 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM54Q969K7 222 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC25A28Q96A46 364 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 PELI1Q96FA3 418 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR8B4Q96RC9 309 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 C1orf198Q9H425 327 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 COPS3Q9UNS2 423 aa14.89□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 RYR3Q15413 4870 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF879B4DU55 563 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 GPX5O75715 221 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 H2BFMP0C1H6 154 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 MSR1P21757 451 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 OMGP23515 440 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 CFL1P23528 166 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 LSM6P62312 80 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 RPS25P62851 125 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ROM1Q03395 351 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 FMODQ06828 376 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 AQP6Q13520 282 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 TAF13Q15543 124 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 KCNMB1Q16558 191 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF404Q494X3 552 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 C10orf128Q5T292 105 aa14.88□□□□□ -0.03
TRAPPC3-209ENST00000616395 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms