RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589860.5

C18orf8-206, Transcript of Uncharacterized protein C18orf8, human

TSL 5

Gene C18orf8, Length 787 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
C18orf8-206	ENST00000589860	DUSP13	Q9UII6	198 aa		13.62	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860		A1L4Q6	167 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	MEGF11	A6BM72	1044 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860		E7EQL1	145 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	LMX1B	O60663	402 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	PLAU	P00749	431 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	CST4	P01036	141 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	IGHV3-13	P01766	116 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	ACKR3	P25106	362 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	VBP1	P61758	197 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	UTS2B	Q765I0	119 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	TPRA1	Q86W33	373 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	OR56B2P	Q8NGI1	322 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	PIGC	Q92535	297 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	ISOC1	Q96CN7	298 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	CKLF	Q9UBR5	152 aa		13.61	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	IGLV3-9	A0A075B6K5	115 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860		A6NIN4	97 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860		A6NNC1	897 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	SLC22A1	O15245	554 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	GMDS	O60547	372 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	CLDN1	O95832	211 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	MYL9	P24844	172 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	MTNR1B	P49286	362 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	EVX1	P49640	407 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	KLF3	P57682	345 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	KBTBD8	Q8NFY9	601 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	OR8G5	Q8NG78	346 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	LILRB1	Q8NHL6	650 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	HIST1H2AA	Q96QV6	131 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	DHRS9	Q9BPW9	319 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	SLC22A4	Q9H015	551 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	RNF167	Q9H6Y7	350 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	NEK6	Q9HC98	313 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	TMEM100	Q9NV29	134 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	FZR1	Q9UM11	496 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		13.6	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	PDCD5	O14737	125 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	TIMM8A	O60220	97 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	NRAS	P01111	189 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	OR4A8	P0C604	315 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	FAH	P16930	419 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	ATF1	P18846	271 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	RAB3A	P20336	220 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	SERPINF1	P36955	418 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	PSMD7	P51665	324 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	PRSS12	P56730	875 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	NCS1	P62166	190 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	PPP3R1	P63098	170 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	MSMP	Q1L6U9	139 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	ZNF672	Q499Z4	452 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	TMEM42	Q69YG0	159 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	USP43	Q70EL4	1123 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	MOB3C	Q70IA8	216 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	ORAI1	Q96D31	301 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	TECTB	Q96PL2	329 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	CHST5	Q9GZS9	411 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	ABCB9	Q9NP78	766 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	GPR160	Q9UJ42	338 aa		13.59	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		13.58	□□□□□ -0.23
C18orf8-206	ENST00000589860	FAM221A	A4D161	298 aa		13.58	□□□□□ -0.24
C18orf8-206	ENST00000589860	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		13.58	□□□□□ -0.24
C18orf8-206	ENST00000589860		H3BMQ9	156 aa		13.58	□□□□□ -0.24
C18orf8-206	ENST00000589860	CDRT1	O95170	752 aa		13.58	□□□□□ -0.24
C18orf8-206	ENST00000589860	ALDOB	P05062	364 aa		13.58	□□□□□ -0.24
C18orf8-206	ENST00000589860	COX6B1	P14854	86 aa		13.58	□□□□□ -0.24
C18orf8-206	ENST00000589860	FST	P19883	344 aa		13.58	□□□□□ -0.24
C18orf8-206	ENST00000589860	PRKACB	P22694	351 aa		13.58	□□□□□ -0.24
C18orf8-206	ENST00000589860	SERPINB10	P48595	397 aa		13.58	□□□□□ -0.24
C18orf8-206	ENST00000589860	ADIPOQ	Q15848	244 aa		13.58	□□□□□ -0.24
C18orf8-206	ENST00000589860	ZNF529	Q6P280	563 aa		13.58	□□□□□ -0.24
C18orf8-206	ENST00000589860	LRP11	Q86VZ4	500 aa		13.58	□□□□□ -0.24
C18orf8-206	ENST00000589860	OR5AS1	Q8N127	324 aa		13.58	□□□□□ -0.24
C18orf8-206	ENST00000589860	OR13G1	Q8NGZ3	307 aa		13.58	□□□□□ -0.24
C18orf8-206	ENST00000589860	NEUROG1	Q92886	237 aa		13.58	□□□□□ -0.24
C18orf8-206	ENST00000589860	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
C18orf8-206	ENST00000589860	PLK3	Q9H4B4	646 aa		13.58	□□□□□ -0.24
C18orf8-206	ENST00000589860	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		13.58	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms