RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 DHDHQ9UQ10 334 aa5.16□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 PIGLQ9Y2B2 252 aa5.16□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF281Q9Y2X9 895 aa5.16□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa5.16□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa5.15□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 RTTNQ86VV8 2226 aa5.15□□□□□ -1.58
CAPNS1-208ENST00000589162 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0B4J203 849 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM212A6NML5 194 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CD300LBA8K4G0 201 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF850A8MQ14 1090 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF879B4DU55 563 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 XRCC2O43543 280 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 PLATP00750 562 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 MAS1P04201 325 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CD3EP07766 207 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CALCBP10092 127 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 NAT2P11245 290 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 EPHA1P21709 976 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CA6P23280 308 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 PTAFRP25105 342 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 GABRA5P31644 462 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 GNALP38405 381 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SERPINB10P48595 397 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CCR9P51686 369 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 PSG7Q13046 419 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CTF1Q16619 201 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CCDC58Q4VC31 144 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 BEX5Q5H9J7 111 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ZMAT1Q5H9K5 638 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM244Q5VVB8 128 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZR03 302 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 LCNL1Q6ZST4 164 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 MOB3CQ70IA8 216 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 PGAP1Q75T13 922 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR86Q86TI4 376 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 NR2C2APQ86WQ0 139 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM169BQ8N8A8 192 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 OR10AD1Q8NGE0 317 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM106AQ96A25 262 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ISOC1Q96CN7 298 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CYYR1Q96J86 154 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 DACH2Q96NX9 599 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 GFI1Q99684 422 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 OR10A4Q9H209 315 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 TPK1Q9H3S4 243 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 KCNK15Q9H427 330 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 MOB1AQ9H8S9 216 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 TBCCD1Q9NVR7 557 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ATPIF1Q9UII2 106 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 STUB1Q9UNE7 303 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF115Q9Y4L5 304 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 V9GYS6 101 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa5.15□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 EPG5Q9HCE0 2579 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 NBASA2RRP1 2371 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0U1RQV5 110 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1W2PPW3 197 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 A6NHS1 94 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 MLNRO43193 412 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 TIMM8AO60220 97 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SC5DO75845 299 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 DHRS3O75911 302 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 GABARAPO95166 117 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CDRT1O95170 752 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 APOC1P02654 83 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ISG15P05161 165 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 OR4A8P0C604 315 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF20P17024 532 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ADRA2CP18825 462 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CCL1P22362 96 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CALRP27797 417 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 GLRXP35754 106 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 RAD52P43351 418 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 CLDN12P56749 244 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP10-9P60411 292 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 MALLQ13021 153 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 PRDX4Q13162 271 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 MADCAM1Q13477 382 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 UBE2V2Q15819 145 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ADIPOQQ15848 244 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 Q499Y3 187 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 YIF1BQ5BJH7 314 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF544Q6NX49 715 aa5.14□□□□□ -1.59
CAPNS1-208ENST00000589162 RHOUQ7L0Q8 258 aa5.14□□□□□ -1.59
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