RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552189.5

SENP1-210, Transcript of SUMO specific peptidase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SENP1, Length 4,967 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP1-210ENST00000552189 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SENP1-210ENST00000552189 SLAMF9Q96A28 289 aa6.99□□□□□ -1.29
SENP1-210ENST00000552189 JAM3Q9BX67 310 aa6.99□□□□□ -1.29
SENP1-210ENST00000552189 HAO2Q9NYQ3 351 aa6.99□□□□□ -1.29
SENP1-210ENST00000552189 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SENP1-210ENST00000552189 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SENP1-210ENST00000552189 BGLAPP02818 100 aa6.99□□□□□ -1.29
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SENP1-210ENST00000552189 TMBIM6P55061 237 aa6.99□□□□□ -1.29
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SENP1-210ENST00000552189 DXOO77932 396 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
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SENP1-210ENST00000552189 KIR2DS1Q14954 304 aa6.99□□□□□ -1.29
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SENP1-210ENST00000552189 SLC23A1Q9UHI7 598 aa6.99□□□□□ -1.29
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SENP1-210ENST00000552189 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.99□□□□□ -1.29
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SENP1-210ENST00000552189 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SENP1-210ENST00000552189 TGM6O95932 706 aa6.99□□□□□ -1.29
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SENP1-210ENST00000552189 DEPPQ9NTK1 212 aa6.99□□□□□ -1.29
SENP1-210ENST00000552189 RNF7Q9UBF6 113 aa6.99□□□□□ -1.29
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SENP1-210ENST00000552189 ZPLD1Q8TCW7 415 aa6.98□□□□□ -1.29
SENP1-210ENST00000552189 RPEQ96AT9 228 aa6.98□□□□□ -1.29
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SENP1-210ENST00000552189 ZNF385DQ9H6B1 395 aa6.98□□□□□ -1.29
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SENP1-210ENST00000552189 CDRT15L2A8MXV6 281 aa6.98□□□□□ -1.29
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SENP1-210ENST00000552189 MESTQ5EB52 335 aa6.98□□□□□ -1.29
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SENP1-210ENST00000552189 U3KQA8 63 aa6.98□□□□□ -1.29
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SENP1-210ENST00000552189 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SENP1-210ENST00000552189 PDCD1Q15116 288 aa6.98□□□□□ -1.29
SENP1-210ENST00000552189 STEAP3Q658P3 488 aa6.98□□□□□ -1.29
SENP1-210ENST00000552189 TFAP2EQ6VUC0 442 aa6.98□□□□□ -1.29
SENP1-210ENST00000552189 CHPT1Q8WUD6 406 aa6.98□□□□□ -1.29
SENP1-210ENST00000552189 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SENP1-210ENST00000552189 NUDT15Q9NV35 164 aa6.98□□□□□ -1.29
SENP1-210ENST00000552189 TUBD1Q9UJT1 453 aa6.98□□□□□ -1.29
SENP1-210ENST00000552189 RAB22AQ9UL26 194 aa6.98□□□□□ -1.29
SENP1-210ENST00000552189 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.98□□□□□ -1.29
SENP1-210ENST00000552189 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
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