RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 CRYBB2P43320 205 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 NPY4RP50391 375 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 GDI2P50395 445 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SLC7A2P52569 658 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 AQP5P55064 265 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 UCP2P55851 309 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 LSM6P62312 80 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 EGR4Q05215 589 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 NPRL3Q12980 569 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 UBE2V1Q13404 147 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 AQP6Q13520 282 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 GGTLC2Q14390 218 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 TRAM2Q15035 370 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 HIST3H3Q16695 136 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF181Q2M3W8 571 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 NDUFAF6Q330K2 333 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SLC36A3Q495N2 470 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM155Q4W5P6 130 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 HIKESHIQ53FT3 197 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 AGKQ53H12 422 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 FAM120AOSQ5T036 256 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 FAM27BQ5VT28 67 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 HACD2Q6Y1H2 254 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC190Q86UF4 302 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 VRK2Q86Y07 508 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 OFCC1Q8IZS5 231 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGAP24Q8N264 748 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF525Q8N782 197 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ZIC4Q8N9L1 334 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SPERTQ8NA61 448 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM239Q8WW34 195 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM54Q969K7 222 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM186Q96B77 213 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 RASD2Q96D21 266 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SGTBQ96EQ0 304 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 PRRC1Q96M27 445 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 DDOQ99489 341 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 DOK1Q99704 481 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGDIGQ99819 225 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 TEX12Q9BXU0 123 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 TXNIPQ9H3M7 391 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 RNF121Q9H920 327 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM38BQ9NVV0 291 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 B3GNT2Q9NY97 397 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 B3GAT1Q9P2W7 334 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF391Q9UJN7 358 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 OR2W1Q9Y3N9 320 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CADP27708 2225 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 USF3Q68DE3 2245 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 FREM1Q5H8C1 2179 aa3.55□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ELOVL7A1L3X0 281 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CLDN34H7C241 214 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 IMPA2O14732 288 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 EDF1O60869 148 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 NME6O75414 186 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 GAGE7O76087 117 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 OR7A10O76100 309 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV3-9P01782 118 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 BGLAPP02818 100 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 TSPAN19P0C672 248 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 GKN3PP0CG01 181 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 GAGE12FP0CL80 117 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 GAGE12GP0CL81 117 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 GAGE12IP0CL82 117 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 PGA4P0DJD7 388 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 PGA3P0DJD8 388 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 IRF2P14316 349 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 ACADSP16219 412 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CCNA2P20248 432 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 IL12AP29459 219 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 PRDX6P30041 224 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CDKN2CP42773 168 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SRP9P49458 86 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 RAD23AP54725 363 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 BIDP55957 195 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 RPL27P61353 136 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 SELENOWP63302 87 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 TUBA1BP68363 451 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 GLO1Q04760 184 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 RELQ04864 619 aaPredicted RBP3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 CD47Q08722 323 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 GAGE1Q13065 139 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 GAGE4Q13068 117 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 LCN1P1Q5VSP4 162 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 BTNL3Q6UXE8 466 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 C16orf82Q7Z2V1 217 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 OAFQ86UD1 273 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 MDP1Q86V88 176 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 IQCF1Q8N6M8 205 aa3.54□□□□□ -1.84
HDAC2-216ENST00000523628 OR2T12Q8NG77 320 aa3.54□□□□□ -1.84
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