RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521941.1

CTNNA1-231, Transcript of catenin alpha 1, human

TSL 3

Gene CTNNA1, Length 224 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNNA1-231	ENST00000521941	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CTNNA1-231	ENST00000521941	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	7.03	□□□□□ -1.28
CTNNA1-231	ENST00000521941	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	IGHV3OR15-7	A0A075B7D8	119 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941		A0A1B0GWJ7	208 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941		A6NIN4	97 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	PPIAL4D	F5H284	164 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	IFNL4	K9M1U5	179 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	P2RY10	O00398	339 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	CLIC3	O95833	236 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	TTR	P02766	147 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	OR2T7	P0C7T2	308 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	FAH	P16930	419 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	EGR1	P18146	543 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	PSMB10	P40306	273 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	GATA4	P43694	442 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	MAP2K3	P46734	347 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	SNRPG	P62308	76 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ZNF85	Q03923	595 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ZNF91	Q05481	1191 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	EGR3	Q06889	387 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	MZT1	Q08AG7	82 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ZNF154	Q13106	437 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ESCO2	Q56NI9	601 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	CEP78	Q5JTW2	689 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	WDR86	Q86TI4	376 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	CELF2-AS1	Q8N7Q2	184 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	SPERT	Q8NA61	448 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	OR2T27	Q8NH04	317 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	LRRC29	Q8WV35	223 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	C1orf159	Q96HA4	380 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	MICU1	Q9BPX6	476 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	RTL8A	Q9BWD3	113 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	AMBN	Q9NP70	447 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ACOXL	Q9NUZ1	547 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	TMEM160	Q9NX00	188 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	RNF7	Q9UBF6	113 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	NUFIP1	Q9UHK0	495 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		7.02	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	TRAV20	A0A0B4J274	112 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941		A0A0U1RQV5	110 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941		A0A1B0GVI7	797 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	DAPL1	A0PJW8	107 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	METTL15	A6NJ78	407 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	SNTN	A6NMZ2	147 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	GYPA	P02724	150 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	FAM157C	P0CG43	387 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	PCMT1	P22061	227 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	DCTD	P32321	178 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	THBS2	P35442	1172 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	GNB2	P62879	340 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ACTC1	P68032	377 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ACTA1	P68133	377 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	TMED1	Q13445	227 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	SNCB	Q16143	134 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	OCLN	Q16625	522 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ZNF404	Q494X3	552 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	LIPN	Q5VXI9	398 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	MOB3C	Q70IA8	216 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	KLB	Q86Z14	1044 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	OR1M1	Q8NGA1	313 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	CNIH3	Q8TBE1	160 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941		Q8TCH9	128 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	HPSE2	Q8WWQ2	592 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ERGIC1	Q969X5	290 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	LGALS12	Q96DT0	336 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	ITPKC	Q96DU7	683 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	RNF170	Q96K19	258 aa		7.01	□□□□□ -1.29
CTNNA1-231	ENST00000521941	TECTB	Q96PL2	329 aa		7.01	□□□□□ -1.29

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