RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 GAS1P54826 345 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 RAP1BP61224 184 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 SRYQ05066 204 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 MYBPHQ13203 477 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 EMC4Q5J8M3 183 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 ABHD17BQ5VST6 288 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 FOXRED2Q8IWF2 684 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 WFDC12Q8WWY7 111 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 GINS4Q9BRT9 223 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 PIGMQ9H3S5 423 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 PLEKHA1Q9HB21 404 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 CHST11Q9NPF2 352 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 HAO2Q9NYQ3 351 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 B9D1Q9UPM9 204 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 SLC22A13Q9Y226 551 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 EMC9Q9Y3B6 208 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 CEP192Q8TEP8 1941 aa7□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 FZD7O75084 574 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 GGCTO75223 188 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 HOXB5P09067 269 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 HOXA5P20719 270 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 PITPNBP48739 271 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00696Q6ZRV3 163 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 FCRLAQ7L513 359 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 OR2G2Q8NGZ5 317 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 LGALS14Q8TCE9 139 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 PHYHIPQ92561 330 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 DERL3Q96Q80 235 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 GPER1Q99527 375 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 ADAM19Q9H013 955 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 ABI3Q9P2A4 366 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 V9GY05 133 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 CBY3A6NI87 242 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 C22orf46C9J442 243 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 IGF2P01344 180 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 PPBPP02775 128 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 MT-ND4LP03901 98 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 CXCL3P19876 107 aa6.99□□□□□ -1.29
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TRPS1-208ENST00000519076 PLGLB1Q02325 96 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 SPEM2Q0P670 501 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 Q499Y3 187 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 BEST4Q8NFU0 473 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 OR2Y1Q8NGV0 311 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 EXTL1Q92935 676 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 FAHD2AQ96GK7 314 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 ATF6BQ99941 703 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 TAS2R5Q9NYW4 299 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 IL17BQ9UHF5 180 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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TRPS1-208ENST00000519076 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 SHISA3A0PJX4 238 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 EREGO14944 169 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 SPDEFO95238 335 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 IGHG1P01857 330 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 UCHL1P09936 223 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 GDF1P27539 372 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 EVX1P49640 407 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 RAC3P60763 192 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 PITPNAQ00169 270 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 IL10RAQ13651 578 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 BCL2L15Q5TBC7 163 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 C19orf48Q6RUI8 117 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 NDUFAF7Q7L592 441 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 THNSL2Q86YJ6 484 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 OR11G2Q8NGC1 345 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.99□□□□□ -1.29
TRPS1-208ENST00000519076 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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