RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 ACOX3O15254 700 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 CLOCKO15516 846 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 HCRTR1O43613 425 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 ZMPSTE24O75844 475 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 TNFSF13O75888 250 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 ELK1P19419 428 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 ME2P23368 584 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 RCVRNP35243 200 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 P2RY2P41231 377 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PSMC5P62195 406 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PSG7Q13046 419 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 AQP6Q13520 282 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 FLOT2Q14254 428 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 C6orf226Q5I0X4 101 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 CLEC18BQ6UXF7 455 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 TAS2R42Q7RTR8 314 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF546Q86UE3 836 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 SLC22A9Q8IVM8 553 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 NKAPP1Q8N9T2 125 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 FBXL13Q8NEE6 735 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 SDR9C7Q8NEX9 313 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 OR7G1Q8NGA0 311 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 OR9K2Q8NGE7 335 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 LILRB4Q8NHJ6 448 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 AKR7LQ8NHP1 331 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 NEIL3Q8TAT5 605 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 NT5C3BQ969T7 300 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 ASB9Q96DX5 294 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 RILPQ96NA2 401 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 C1orf50Q9BV19 199 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 C20orf85Q9H1P6 137 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 METTL7AQ9H8H3 244 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 C8orf4Q9NR00 106 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 FBXO8Q9NRD0 319 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 ARMC1Q9NVT9 282 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PSME2Q9UL46 239 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 HES2Q9Y543 173 aa2.99□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 AP4S1Q9Y587 144 aa2.99□□□□□ -1.93
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POLR1B-215ENST00000498054 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP2.99□□□□□ -1.93
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POLR1B-215ENST00000498054 LOC100653049A0A140TA62 436 aa2.98□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PSMB11A5LHX3 300 aa2.98□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM150BA6NC51 233 aa2.98□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 CLDN25C9JDP6 229 aa2.98□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 H0Y9J4 135 aa2.98□□□□□ -1.93
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POLR1B-215ENST00000498054 M0QX08 132 aa2.98□□□□□ -1.93
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POLR1B-215ENST00000498054 KRT34O76011 436 aa2.98□□□□□ -1.93
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POLR1B-215ENST00000498054 CCNJQ5T5M9 372 aa2.98□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 GPR107Q5VW38 600 aa2.98□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 XAF1Q6GPH4 301 aa2.98□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 IL34Q6ZMJ4 242 aa2.98□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa2.98□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 PRSS41Q7RTY9 318 aa2.98□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 SH2D6Q7Z4S9 175 aa2.98□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 C10orf107Q8IVU9 208 aa2.98□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 TPRX1Q8N7U7 411 aa2.98□□□□□ -1.93
POLR1B-215ENST00000498054 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa2.98□□□□□ -1.93
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