RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 CAPZA1P52907 286 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 CAV3P56539 151 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 MTPNP58546 118 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 IL5RAQ01344 420 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ZNF92Q03936 586 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 MEP1BQ16820 701 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 SLC36A3Q495N2 470 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 STUMQ69YW2 141 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 GPR139Q6DWJ6 353 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 CCDC80Q76M96 950 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 RRM2BQ7LG56 351 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 DHDDSQ86SQ9 333 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 NRMQ8IXM6 262 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 LINC00482Q8N8I6 264 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 LRRC75AQ8NAA5 344 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 TMEM185AQ8NFB2 350 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 OR1M1Q8NGA1 313 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 OR5T2Q8NGG2 359 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 OR2AE1Q8NHA4 323 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 PIFOQ8TCI5 191 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ZNF799Q96GE5 643 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 AJUBAQ96IF1 538 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 RCHY1Q96PM5 261 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 NUAK2Q9H093 628 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 SNTG1Q9NSN8 517 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 HAO2Q9NYQ3 351 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 LHFPL6Q9Y693 200 aa4.96□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 A6NDX4 124 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ANXA2P2A6NMY6 339 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 NUDT19A8MXV4 375 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 SOCS2O14508 198 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 CDIPTO14735 213 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 SIGLEC5O15389 551 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 SNX3O60493 162 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ARG1P05089 322 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 TNFRSF1BP20333 461 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 DDOSTP39656 456 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 GPR4P46093 362 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 OR1E2P47887 323 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 RAB13P51153 203 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 GP2P55259 537 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 OR12D2P58182 307 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ERVFRD-1P60508 538 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 BLCAPP62952 87 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 CSNK2BP67870 215 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 HIST1H3AP68431 136 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 SPIBQ01892 262 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 KCNMB1Q16558 191 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 RFX4Q33E94 735 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 SNAI3Q3KNW1 292 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ZBED5Q49AG3 693 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 AGKQ53H12 422 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 NKAPLQ5M9Q1 402 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 GLYATL3Q5SZD4 288 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ZFAND6Q6FIF0 208 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 HCP5Q6MZN7 132 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 WDR82Q6UXN9 313 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ZNF730Q6ZMV8 503 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 CFAP77Q6ZQR2 320 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 HIST2H3AQ71DI3 136 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 NAA40Q86UY6 237 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 LINC00346Q8IVM7 164 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 FUNDC1Q8IVP5 155 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 MKXQ8IYA7 352 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 OR6V1Q8N148 313 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 CYB561A3Q8NBI2 242 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 FAM156AQ8NDB6 213 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 OR52H1Q8NGJ2 320 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 OR4C15Q8NGM1 316 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 OR10A6Q8NH74 314 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 SEH1LQ96EE3 360 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 PRRC1Q96M27 445 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 GAFA1Q96PS6 74 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 CGREF1Q99674 301 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 MICU1Q9BPX6 476 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 FNDC11Q9BVV2 318 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 FAM107BQ9H098 131 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 RABEP2Q9H5N1 569 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 SAR1AQ9NR31 198 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa4.95□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 ANGPT2O15123 496 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 TBX1O43435 398 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 XRCC2O43543 280 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 CCDC22O60826 627 aa4.94□□□□□ -1.62
CBX1-205ENST00000495350 JTBO76095 146 aa4.94□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms