RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 CHRNA9Q9UGM1 479 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 C2orf72A6NCS6 295 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5H15A6NDH6 313 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 A6NLC8 198 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF726A6NNF4 738 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SOX15O60248 233 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CEACAM4O75871 244 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 NEURL1O76050 574 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 NDUFB2O95178 105 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 F12P00748 615 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 BGLAPP02818 100 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ADRA2AP08913 450 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ELK1P19419 428 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FUT1P19526 365 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 WT1P19544 449 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 GABRR1P24046 479 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 AGTR1P30556 359 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SRD5A2P31213 254 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ELFN2Q5R3F8 820 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 C1orf140Q5VVS0 124 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10K2Q6IF99 312 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 B3GLCTQ6Y288 498 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PTCHD4Q6ZW05 846 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 LINGO2Q7L985 606 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MDGA2Q7Z553 956 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MDS2Q8NDY4 140 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 HAS2Q92819 552 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SAMD8Q96LT4 415 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PCGF1Q9BSM1 259 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CHST11Q9NPF2 352 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OPN4Q9UHM6 478 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 LHX6Q9UPM6 363 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TMED3Q9Y3Q3 217 aa6.42□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM171A2A8MVW0 826 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 NPIPA2E9PIF3 369 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 BHLHE40O14503 412 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 DVL1O14640 695 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 GMFGO60234 142 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 GOSR1O95249 250 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CH25HO95992 272 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TFPIP10646 304 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 DPP4P27487 766 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FXYD6P3P58550 94 aa6.41□□□□□ -1.38
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SMARCE1-211ENST00000493660 PITPNAQ00169 270 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 HGFACQ04756 655 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 FHL1Q13642 323 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MELKQ14680 651 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR1C1Q15619 314 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 IDNKQ5T6J7 187 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF626Q68DY1 528 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF573Q86YE8 665 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SIAH3Q8IW03 269 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10AD1Q8NGE0 317 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MFSD8Q8NHS3 518 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 PHYHIPQ92561 330 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TAAR8Q969N4 342 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 SMIM8Q96KF7 97 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CA10Q9NS85 328 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 GNG8Q9UK08 70 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 DKKL1Q9UK85 242 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 VDAC3Q9Y277 283 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 NCKAP5O14513 1909 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CACNA1AO00555 2505 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 MED13Q9UHV7 2174 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CEP250Q9BV73 2442 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV27A0A087WT01 109 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 LRRC3CA6NJW4 275 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5H1A6NKK0 313 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 F5H5P2 479 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 ARPC3O15145 178 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 BCL2L11O43521 198 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TCF21O43680 179 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 GPRIN2O60269 458 aa6.41□□□□□ -1.38
SMARCE1-211ENST00000493660 NME2P1O60361 137 aa6.41□□□□□ -1.38
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