RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 CCDC127Q96BQ5 260 aa3.47□□□□□ -1.85
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CCL20-204ENST00000489160 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 BTN2A3PQ96KV6 586 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 DEFB127Q9H1M4 99 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 CENPHQ9H3R5 247 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 DSN1Q9H410 356 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 PDFQ9HBH1 243 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 ACOT13Q9NPJ3 140 aa3.47□□□□□ -1.85
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CCL20-204ENST00000489160 ACOT9Q9Y305 439 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 KLF12Q9Y4X4 402 aa3.47□□□□□ -1.85
CCL20-204ENST00000489160 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa3.47□□□□□ -1.85
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CCL20-204ENST00000489160 NUP160Q12769 1436 aa3.46□□□□□ -1.86
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CCL20-204ENST00000489160 FAM189A1O60320 539 aa3.46□□□□□ -1.86
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CCL20-204ENST00000489160 MMP23AO75900 390 aa3.46□□□□□ -1.86
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CCL20-204ENST00000489160 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 RPS23P62266 143 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
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CCL20-204ENST00000489160 CHRFAM7AQ494W8 412 aa3.46□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 SMUG1Q53HV7 270 aa3.46□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 TFDP3Q5H9I0 405 aa3.46□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 CDKL4Q5MAI5 379 aa3.46□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 OTPQ5XKR4 325 aa3.46□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 HBMQ6B0K9 141 aa3.46□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ZNF493Q6ZR52 646 aa3.46□□□□□ -1.86
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CCL20-204ENST00000489160 C7orf33Q8WU49 177 aa3.46□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 DCUN1D4Q92564 292 aa3.46□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
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CCL20-204ENST00000489160 SMIM10Q96HG1 83 aa3.46□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 IMMP1LQ96LU5 166 aa3.46□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ZIM3Q96PE6 472 aa3.46□□□□□ -1.86
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CCL20-204ENST00000489160 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.46□□□□□ -1.86
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CCL20-204ENST00000489160 CELA1Q9UNI1 258 aa3.46□□□□□ -1.86
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CCL20-204ENST00000489160 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa3.45□□□□□ -1.86
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CCL20-204ENST00000489160 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 SMIM23A6NLE4 172 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 H7C417 338 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 CYTH3O43739 400 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
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CCL20-204ENST00000489160 CCNE1P24864 410 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 EVI2BP34910 448 aa3.45□□□□□ -1.86
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CCL20-204ENST00000489160 TUFMP49411 452 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 MTPNP58546 118 aa3.45□□□□□ -1.86
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CCL20-204ENST00000489160 REG3AQ06141 175 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 TRAM1Q15629 374 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 BCL2A1Q16548 175 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 STRADAQ7RTN6 431 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 STX12Q86Y82 276 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 PRSS58Q8IYP2 241 aa3.45□□□□□ -1.86
CCL20-204ENST00000489160 DAW1Q8N136 415 aa3.45□□□□□ -1.86
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