RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482013.1

GGPS1-205, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene GGPS1, Length 470 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-205ENST00000482013 BTG1P62324 171 aa10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 PMPCAQ10713 525 aa10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 PLA2G7Q13093 441 aa10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 TNK1Q13470 666 aa10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 KISS1Q15726 138 aa10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 UBE2V2Q15819 145 aa10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 C11orf91Q3C1V1 193 aa10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 C1orf185Q5T7R7 199 aa10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 ZNF585AQ6P3V2 769 aa10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 C17orf78Q8N4C9 275 aa10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 OR5L1Q8NGL2 311 aa10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 OR52I2Q8NH67 350 aa10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 FAM57AQ8TBR7 257 aa10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 POM121Q96HA1 1249 aa10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 GPER1Q99527 375 aa10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 MARVELD1Q9BSK0 173 aa10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 DPAGT1Q9H3H5 408 aa10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 MOV10Q9HCE1 1003 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 OBP2BQ9NPH6 170 aa10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 KCNN3Q9UGI6 736 aa10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa10.15□□□□□ -0.78
GGPS1-205ENST00000482013 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 C5orf49A4QMS7 147 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 SSX4O60224 188 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 GMDSO60547 372 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 ICMTO60725 284 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 CGAP01215 116 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 IL2RAP01589 272 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 MELTFP08582 738 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 CSF1P09603 554 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 TUBG1P23258 451 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 ACKR3P25106 362 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 FAUP35544 74 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 RAG2P55895 527 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 ZNF92Q03936 586 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 P2RY6Q15077 328 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 GABRA6Q16445 453 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 TBC1D28Q2M2D7 210 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 PLA1AQ53H76 456 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 OLFML2AQ68BL7 652 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 BEND4Q6ZU67 534 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 GCNT2Q8N0V5 402 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 OR2AE1Q8NHA4 323 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 GPX8Q8TED1 209 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 CREB3L1Q96BA8 519 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 NEURL2Q9BR09 285 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 CST11Q9H112 138 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 AUNIPQ9H7T9 357 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 NOX3Q9HBY0 568 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 TUBG2Q9NRH3 451 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 PROCRQ9UNN8 238 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 SLC7A11Q9UPY5 501 aa10.14□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 RAB27BO00194 218 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 TNFSF13O75888 250 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 KDM4BO94953 1096 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 CST4P01036 141 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 TRAPPC2P0DI81 140 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 TRAPPC2BP0DI82 140 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 CBR1P16152 277 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 RBP2P50120 134 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 FUT6P51993 359 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 ATP1B3P54709 279 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 PER3P56645 1201 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 ACTBP60709 375 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 ACTG1P63261 375 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 UNC119Q13432 240 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 ARL6IP1Q15041 203 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 ZNF260Q3ZCT1 412 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 HIKESHIQ53FT3 197 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 AGAP6Q5VW22 663 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 RTL6Q6ICC9 239 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 CRIP3Q6Q6R5 217 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 ASCL4Q6XD76 172 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 BIVMQ86UB2 503 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 MDP1Q86V88 176 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 ZNF584Q8IVC4 421 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 ZNF101Q8IZC7 436 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 GABRG1Q8N1C3 465 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 FAM169BQ8N8A8 192 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 STEAP2Q8NFT2 490 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 STARD4Q96DR4 205 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 S100A13Q99584 98 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 ACTR6Q9GZN1 396 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 NLKQ9UBE8 527 aa10.13□□□□□ -0.79
GGPS1-205ENST00000482013 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.1 ms