RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467308.1

TSSC4-208, Transcript of tumor suppressing subtransferable candidate 4, human

TSL 3

Gene TSSC4, Length 409 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSSC4-208	ENST00000467308	WNT4	P56705	351 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	IL13RA1	P78552	427 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	BDH1	Q02338	343 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	AQP6	Q13520	282 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	SPHAR	Q15513	63 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	MEP1B	Q16820	701 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	DEGS2	Q6QHC5	323 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	PLEKHG7	Q6ZR37	379 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	DEFB108B	Q8NET1	73 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	COG8	Q96MW5	612 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	ALG8	Q9BVK2	526 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	CGGBP1	Q9UFW8	167 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	COPS3	Q9UNS2	423 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		13.26	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	CLDN34	H7C241	214 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	SPRY3	O43610	288 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	SPARC	P09486	303 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	PSKH1	P11801	424 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	STOM	P27105	288 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	PCBD1	P61457	104 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	SGCA	Q16586	387 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	RNF133	Q8WVZ7	376 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	RORB	Q92753	470 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	DIRC2	Q96SL1	478 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	ABHD6	Q9BV23	337 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	EMC7	Q9NPA0	242 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF69	Q9UC07	566 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	KLHDC2	Q9Y2U9	406 aa		13.25	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308		H3BSA7	217 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF254	O75437	659 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	CD55	P08174	381 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	DCTD	P32321	178 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	HCCS	P53701	268 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF154	Q13106	437 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	TMEM255A	Q5JRV8	349 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	SSX6	Q7RTT6	188 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	LRRC18	Q8N456	261 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	GJC3	Q8NFK1	279 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	OR2AJ1	Q8NGZ0	328 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	SLC25A28	Q96A46	364 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	DUX5	Q96PT3	197 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	TBX5	Q99593	518 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	SLITRK2	Q9H156	845 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	MMP26	Q9NRE1	261 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	EIF3K	Q9UBQ5	218 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	NPTN	Q9Y639	398 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	AUP1	Q9Y679	476 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	VWF	P04275	2813 aa		13.24	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	METTL15	A6NJ78	407 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	ZSCAN5B	A6NJL1	495 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	ABHD16A	O95870	558 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	IGHV2-70	P01814	119 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	ZNF12	P17014	697 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	CCNO	P22674	350 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	MPV17	P39210	176 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	WNT5A	P41221	380 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	TAS2R43	P59537	309 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	BAMBI	Q13145	260 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	EIF2B1	Q14232	305 aa	Known RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	NEDD8	Q15843	81 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	KLF17	Q5JT82	389 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	SPIC	Q8N5J4	248 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	KLF14	Q8TD94	323 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	THEM6	Q8WUY1	208 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	MAP6	Q96JE9	813 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	OR5M11	Q96RB7	305 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	OR8B4	Q96RC9	309 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	NIPAL2	Q9H841	368 aa		13.23	□□□□□ -0.29
TSSC4-208	ENST00000467308	BATF3	Q9NR55	127 aa		13.23	□□□□□ -0.29

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